本发明涉及农业和水产生物检测,具体涉及一种用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒及检测方法。
背景技术:
1、虾肝肠胞虫(enterocytozoon hepatopenaei,ehp),是近年在虾养殖行业发现的一种专门性细胞内寄生病原体,容易感染凡纳滨对虾、脊尾白虾和斑节对虾等主要经济养殖虾类,是影响全球虾类养殖生产的重要病原之一。感染虾肝肠胞虫的个体前期无明显的症状,中期行动迟缓且伏底、嗜睡、食欲下降、应激能力下降、甲壳松弛等;感染2-3个月时,病虾生长速度减缓甚至停止生长,其体型仅为健康虾的一半大小,个别病虾出现排白便症状。虽然感染虾肝肠胞虫的对虾不会发生急性死亡,但造成的对虾滞长,且症状随着感染时间的增加而加重, 可能引起对虾的慢性死亡,严重影响了对虾养殖业和食品安全,从而导致较大的经济损失。
2、目前,虾肝肠胞虫的检测技术取得了较大的进展,建立了虾肝肠胞虫的组织学检测技术、分子生物学检测技术等,比如在中国发明专利201710917654.4中通过恒温扩增方法提供了一种检测虾肝肠孢虫的荧光试剂盒,虽然无精密实验仪器设备需求,但其特异性较低,容易出现假阳性等问题;在中国发明专利201811501504.6中基于虾肝肠胞虫的swp1基因保守区域设计了一组引物,但pcr扩增后需要进行琼脂糖凝胶电泳,在开盖过程中易造成气溶胶污染,且该方法检测限高,易出现假阴性,耗时耗力。因此,设计高效实用的虾肝肠胞虫的检测试剂盒具有重要意义和应用价值。
技术实现思路
1、针对现有技术的缺陷,本发明设计了一种用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒以及使用该试剂盒的检测方法,具有操作简便、高特异性、高灵敏度以及无气溶胶污染的特点。
2、为了实现上述目的,本发明解决技术问题采用如下技术方案:
3、一方面,本发明基于mb-qpcr技术设计了一种用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,mb-qpcr 具有操作简单、敏感、并能对样品进行实时扩增检测,且其与普通的线性寡核苷酸探针相比,茎环型结构的分子信标对靶序列中单个碱基的错配、缺失或插入突变均能检测出来。
4、所述试剂盒包括mb-qpcr mix、enzyme mix、阴性质控品、阳性质控品;其中所述mb-qpcr mix包括20mm~80m且ph为7.5~8.9的tris-hcl、10mm~50mm 含u的dntp、100mm~4mkcl、1mm~50mm mgcl2、0.01%~0.3%(v/v)tween-20、0.01%~0.1%(v/v)四氢噻吩1-氧化物、10mm~5m 四甲基氯化铵、10mm~100mm甜菜碱、0.01%~0.1%(v/v) dmso、0.01%~0.3%(v/v)triton x-100、50mm~500mm上游引物、50mm~500mm下游引物、25mm~250mm mb荧光探针。
5、优选地,所述上游引物是如seq id no.1所示的序列,所述下游引物是如seq idno.2所示的序列,所述mb荧光探针是如seq id no.3所示的序列。
6、优选地,所述mb荧光探针的5’端连接有荧光发光基团,且3’端连接有荧光猝灭基团。所述荧光发光基团包括fam、vic、hex、joe、rox、texas-red、cy5的一种;所述荧光猝灭基团包括dabcyl、dabsyl、tamra、bhq-1、bhq-2、bhq-3的一种。
7、优选地,所述enzyme mix包括热启动taq酶0.5u~2u、udg酶0.1u~10u、rnaseinhibiter 1u~10u、1%~50%(v/v)甘油、10mm~200mm的钾离子与0.01mm~1mm的edta。
8、优选地,所述阳性质控品包括利用如seq id no.4所示的虾肝肠胞虫靶基因序列合成的质粒溶液。
9、另一方面,本发明还提供了一种非诊断目的检测虾肝肠胞虫的方法,采用所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒。
10、优选地,所述方法包括以下步骤:
11、s1:提取样本核酸;
12、s2:将步骤s1提取的核酸作为模板,进行pcr扩增反应,反应结束后对检测结果进行判定。
13、优选地,所述步骤s2中采用25μl的pcr扩增体系,包括19μl mb-qpcr mix、1μl酶混合液、5μl模板。
14、优选地,所述pcr扩增反应条件为:95℃ 3min;95℃ 10s,58℃ 30s,40个循环。
15、优选地,所述结果判定为:当ct值<35且出现典型的扩增曲线,则结果为阳性;当35≤ct<37扩增曲线呈s型,可疑样本需复检;复检结果一致则判断为虾肝肠胞虫阳性,否则为虾肝肠胞虫阴性;当ct值≥37或无扩增曲线,结果为阴性。
16、与现有技术相比,本发明具有如下的有益效果:
17、本发明通过mb-qpcr技术提供了一种检测虾肝肠胞虫的试剂盒,为检测虾肝肠胞虫技术领域提供了新思路,所述试剂盒具有操作简便、高特异性、高灵敏度的特点。
18、相比现有的普通pcr技术,本发明的试剂盒以及检测方法操作简单,并且pcr结束后可直接进行结果判读,整个检测在30min内即可检验出结果,减少了人力物力及时间成本,可以对虾肝肠胞虫实现实时监控,有利于及时发现和响应病毒爆发,以及评估虾健康养殖的风险,为指导对虾科学养殖提供了理论依据。
19、并且,本发明无需开盖等后续实验处理与分析,避免了不同扩增产物间的交叉污染,同时也减少假阳性的发生,测试结果准确可靠。
20、此外,所述试剂盒可于室温下存放一周,4℃放置半年,-20℃存放2年,反复冻融10次以上对其性能不造成任何影响。
1.一种用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括mb-qpcr mix、enzyme mix、阴性质控品、阳性质控品;其中所述mb-qpcr mix包括20mm~80m且ph为7.5~8.9的tris-hcl、10mm~50mm含u的dntp、100mm~4m kcl、1mm~50mm mgcl2、0.01%~0.3%(v/v)tween-20、0.01%~0.1%(v/v)四氢噻吩1-氧化物、10mm~5m 四甲基氯化铵、10mm~100mm甜菜碱、0.01%~0.1%(v/v)dmso、0.01%~0.3%(v/v)triton x-100、50mm~500mm上游引物、50mm~500mm下游引物、25mm~250mm mb荧光探针。
2.根据权利要求1所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,其特征在于,所述上游引物是如seq id no.1所示的序列,所述下游引物是如seq id no.2所示的序列,所述mb荧光探针是如seq id no.3所示的序列。
3.根据权利要求2所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,其特征在于,所述mb荧光探针的5’端连接有荧光发光基团,且3’端连接有荧光猝灭基团;所述荧光发光基团包括fam、vic、hex、joe、rox、texas-red、cy5的一种;所述荧光猝灭基团包括dabcyl、dabsyl、tamra、bhq-1、bhq-2、bhq-3的一种。
4.根据权利要求1所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,其特征在于,所述enzyme mix包括热启动taq酶0.5u~2u、udg酶0.1u~10u、rnase inhibiter 1u~10u、1%~50%(v/v)甘油、10mm~200mm的钾离子与0.01mm~1mm的edta。
5.根据权利要求1所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒,其特征在于,所述阳性质控品包括利用如seq id no.4所示的虾肝肠胞虫靶基因序列合成的质粒溶液。
6.一种非诊断目的检测虾肝肠胞虫的方法,其特征在于,采用权利要求1-5任一项所述的用于快速检测虾肝肠胞虫的mb-qpcr检测试剂盒。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤s2中采用25μl的pcr扩增体系,包括19μl mb-qpcr mix、1μl酶混合液、5μl模板。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述pcr扩增反应条件为:95℃ 3min;95℃10s,58℃ 30s,40个循环。
10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述结果判定为:当ct值<35且出现典型的扩增曲线,则结果为阳性;当35≤ct<37扩增曲线呈s型,可疑样本需复检;复检结果一致则判断为虾肝肠胞虫阳性,否则为虾肝肠胞虫阴性;当ct值≥37或无扩增曲线,结果为阴性。
