本发明属于动物遗传育种领域，具体涉及一种与藏鸡低氧适应性相关的分子标记及其应用。该方法通过分子遗传学手段，提升藏鸡在高原低氧环境中的适应能力。
背景技术：
1、在高海拔环境中，动物面临低氧挑战，需要通过组织和器官的变化来适应高原环境，尤其是与氧气交换、运输和代谢相关的器官。藏鸡是青藏高原特有的小型鸡种，长期生活在高海拔、低氧环境中，形成了独特的生理和遗传特征。高原地区的低氧环境对家禽的生存和繁殖构成了严峻挑战，传统的育种方法主要依赖于表型选择，但这种方法存在一些不足之处。表型选择通常只关注外在特征，而忽略了基因层面的多样性，这可能导致遗传多样性的丧失，使鸡群对环境变化和疾病的抵抗力降低。另外，表型选择的效率较低，尤其是在涉及复杂性状（如抗病性或适应性）时，需要较长时间来观察和评估个体表现。此外，表型特征容易受到环境因素的影响，可能导致选择结果不准确。例如，在高海拔地区，低氧环境可能影响鸡的生长和繁殖表现，而这些变化不一定反映在基因水平上。传统方法也难以识别隐性性状，一些重要性状可能是隐性的，难以通过表型直接观察到。最后，在特殊环境（如高海拔低氧环境）中，传统方法可能无法快速有效地培育出适应性更强的品种。未能充分利用分子遗传学手段来提高藏鸡的低氧适应性。难以有效提高藏鸡的低氧适应能力。
2、因此，开发一种与藏鸡低氧适应性相关的分子标记及其应用，不仅可以提高藏鸡在高原低氧环境中的存活率和生产性能，还能为其他高原家禽的育种提供参考。
技术实现思路
1、为了解决藏鸡在高原低氧环境中面临的适应性挑战和存活问题，本发明探索了一种基于park7基因的育种方法，以提高藏鸡在低氧环境中的适应能力。
2、为实现上述目的，本申请采取了以下技术方案：
3、本申请第一方面提供了一种用于藏鸡低氧适应性选育的核酸分子标记，核酸分子标记的核苷酸序列如seq id no：1所示；核酸分子标记的单核苷酸m的位置位于gallusgallus domesticuss参考基因组grcg6a版本21号染色体264837核苷酸位点g>t突变；其位置在序列seq id no：1中，为5'端的第224位。
4、本申请第二方面提供了一种用于检测上述的核酸分子标记的引物对，引物对用于检测核酸分子标记，引物对包括上游引物和下游引物；上游引物的核苷酸序列如seq idno：2所示；下游引物的核苷酸序列如seq id no：3所示。
5、本申请第三方面提供了一种用于检测上述的核酸分子标记的试剂盒，试剂盒包含上述的引物对。
6、本申请第四方面提供了一种低氧环境下藏鸡的选育方法，选育方法具体包括：
7、1）通过检测所述藏鸡的21号染色体上述的核酸分子标记；
8、2）保留核酸分子标记的单核苷酸m为g的鸡群个体，淘汰单核苷酸m为t的鸡群个体；以逐代提高该单核苷酸m为t的基因频率；
9、核酸分子标记的单核苷酸m的位置在序列seq id no：1中，为5'端的第224位。
10、本申请第五方面提供了一种上述的选育方法在提高藏鸡个体上park7基因。
11、应当理解的是，以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的，并不能限制本申请。
12、有益效果
13、1、本申请对连续海拔地区的188只鸡采集全血，并提取dna进行重测序，对这些连续海拔地区的鸡群重测序数据进行过滤、比对、筛选、注释，获得变异snps集；通过基因组重测序技术和多种遗传分析方法，识别出与高原适应相关的park7基因核酸分子标记。通过遗传变异分析、群体遗传结构分析和正向选择扫描，获得强烈选择信号的snp位点，并通过go与kegg富集分析确定基因富集的通路和生物学功能。这一过程提高了选择信号的筛选准确性，为后续功能位点的实验验证提供了坚实的数据支撑。
14、2、本发明提供了一种与藏鸡高原适应性相关的park7基因核酸分子标记，并设计了用于鉴定该标记的引物对。通过核酸分子标记辅助选择，能够有效提高藏鸡在高原低氧环境中的适应能力，增强其生存和生产性能。这种遗传改良有助于提高藏鸡在高原环境中的氧气运输能力和抗氧化能力，增强其对低氧、强紫外线和低温等环境的适应性。
15、3、通过优选park7基因核酸分子标记的优势等位基因，本发明能够提高藏鸡的遗传进展，从而有效提高育种效率。通过将gt型和tt型个体选育成gg型个体，增强藏鸡的高原适应性和生理稳定性，维护其生理平衡，进一步提高其在高原环境中的生存能力。
16、4、本发明通过基因组重测序技术和转录组学分析，提供了一种精确的核酸分子标记工具，用于研究和改良藏鸡的高原适应性。该核酸分子标记能够准确定位与park7基因表达量相关的遗传因素，减少育种过程中的不确定性，改善藏鸡在高原地区的生存和生长能力，从而提高高原地区藏鸡养殖的经济效益。
17、5、本发明提供了对park7基因进行的实验验证，观察其在低氧条件下对藏鸡心肌细胞的保护作用。通过基因敲除和过表达实验，确认park7基因在细胞抗氧化及保护机制中的功能。
18、6、本申请提供了一种与park7基因表达量相关的核酸分子标记，通过基因组重测序、转录组分析和验证实验来更精确地研究与鸡群高原适应相关park7基因表达量的遗传因素。该核酸分子标记能够解决以下问题：
19、1）提高准确性：提供了一种与鸡群高原适应相关park7基因表达量相关核酸分子标记，能够更准确地定位鸡群高原适应相关的park7基因，而不仅仅依赖于随机选择的候选基因。
20、2）减少不确定性：提供了一种与鸡群高原适应相关park7基因表达量相关核酸分子标记可降低不确定性，通过基因敲除和过表达实验，确认park7基因在细胞抗氧化及保护机制中的功能，通过优选该核酸分子标记的优势等位基因，能够改善鸡群中park7基因表达量的遗传进展，改善鸡群在高原地区的生存和生长能力，从而提高高海拔地区改良藏黄牛养殖的经济效应。
21、3）提供精确工具：本申请提供的核酸分子标记为位于seq idno:1序列标注位置为224位的g224-t224的核苷酸突变；所述的核酸分子标记的单核苷酸m的位置位于gallusgallus domesticuss参考基因组grcg6a版本21号染色体264837核苷酸位点g>t突变；其位置在序列seq id no：1中，为5'端的第224位核苷酸。将为改善鸡群在高原地区的生存和生长能力提供更为准确的遗传工具，为改善鸡群在高原地区的生存和生长能力提供了理论基础。
22、应当理解的是，以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的，并不能限制本申请。
1.一种用于藏鸡低氧适应性选育的核酸分子标记，其特征在于，所述核酸分子标记的核苷酸序列如seq id no：1所示；所述核酸分子标记的单核苷酸m的位置位于gallusgallus domesticuss参考基因组grcg6a版本21号染色体264837核苷酸位点g>t突变；其位置在序列seq id no：1中，为5'端的第224位。
2.一种用于检测如权利要求1所述的核酸分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括上游引物和下游引物；所述上游引物的核苷酸序列如seq id no：2所示；所述下游引物的核苷酸序列如seq id no：3所示。
3.一种用于检测如权利要求1所述核酸分子标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求2所述的引物对。
4.一种检测藏鸡心肌细胞活力的方法，其特征在于，所述方法包括：
5.一种低氧环境下藏鸡的选育方法，其特征在于，所述选育方法具体包括：
6.一种根据权利要求5所述的选育方法在提高藏鸡个体上park7基因的表达量的应用。
