桥连型人工核酸ALNA的制作方法

专利2025-04-10  21


本发明涉及氨基lna的单体、及包含其的低聚物。


背景技术:

1、作为基于核酸药物的疾病的治疗方法,包括反义法、反基因法、使用适体的方法、使用sirna的方法等。其中,反义法是如下方法:通过从外部导入与和疾病有关的mrna、非翻译rna互补的寡核苷酸(反义链),使其形成双链,从而调节与疾病有关的rna的功能,进行疾病的治疗、预防。

2、作为这样的核酸药物的原材料,开发了各种人工核酸,但还存在避免全身给药后的肝脏、肾脏这样的核酸药物容易蓄积的器官的毒性、显现充分的药效这样的课题,尚不存在应该成为王牌的分子。对于1998年由wengel等开发的2’-氨基lna(locked nucleicacid,锁核酸)(以下,表示为“alna”)(专利文献1、及非专利文献1)而言,可以通过从2’位起的取代基修饰来合成多种人工核酸,以烷基、酰基为中心,迄今为止已合成了许多alna衍生物(专利文献2~4、及非专利文献2~11),虽然报道了全身给药后的特征性组织分布(非专利文献12),但在药理活性方面不充分,迄今为止,未进行在医药品中的应用。

3、我们应用之前发现的guna的高效的合成方法(专利文献5、及非专利文献13),进一步进行多种多样的新型alna衍生物的合成,并且广泛实施专用于药理活性评价的筛选,由此,发现具有比现有的alna更优异的体外(in vitro)、及体内(in vivo)药理活性的新型人工核酸,从而完成了本发明。

4、现有技术文献

5、专利文献

6、专利文献1:国际公开第99/014226号

7、专利文献2:国际公开第2013/013068号

8、专利文献3:国际公开第2014/124952号

9、专利文献4:国际公开第2016/128583号

10、专利文献5:国际公开第2017/047816号

11、非专利文献

12、非专利文献1:s.k.singh等,j.org.chem.1998年,第63卷,第6078-6079页

13、非专利文献2:m.d.sorensen等,chem.commun.2003年,第2130页

14、非专利文献3:b.r.babu等,chem.commun.2005年,第13卷,第1705-1707页

15、非专利文献4:t.bryld等,nucleosides,nucleotides&nucleic acids 2007年,第26卷,第1645-1647页

16、非专利文献5:m.kalek等,j.am.chem.soc.2007年,第129卷,第9392-9400页.

17、非专利文献6:t.umemoto等,org.biomol.chem.2009年,第7卷,第1793-1797页

18、非专利文献7:m.w.johannsen等,org.biomol.chem.2011年,第9卷,第243-252页

19、非专利文献8:a.s.jφrgensen等,chem.commun.2013年,第49卷,第10751-10753页

20、非专利文献9:i.k.astakhova等,acc.chem.res.2014年,第47卷,第1768-1777页

21、非专利文献10:c.lou等,chem.commun.2015年,第51卷,第4024-4027页

22、非专利文献11:a.ries等,j.org.chem.2016年,第81卷,第10845-10856页

23、非专利文献12:k.fluiter等,chem.bio.chem.2005年,第6卷,第1104-1109页

24、非专利文献13:h.sawamoto等,org.lett.2018年,第20卷,第1928-1931页


技术实现思路

1、发明所要解决的课题

2、本发明涉及新型的桥连型人工核酸、以及包含其作为单体的低聚物。

3、用于解决课题的手段

4、为了解决前述课题,本技术的发明人进行了深入研究,结果,如下所示,发现新型的2’-氨基lna及其盐、以及包含其作为单体的低聚物,从而完成了本发明。

5、即,本发明涉及以下的项〔1〕~〔33〕,但不受它们的限制。

6、项〔1〕通式(i)表示的化合物或其盐。

7、[化学式1]

8、

9、[式中,

10、b为可以被1个以上取代基取代的核酸的碱基部分;

11、r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子、或可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基;

12、r5及r6各自独立地为氢原子、羟基的保护基、或可以被取代的磷酸基;

13、m为1或2;

14、x为下述式(ii-1)、(ii-2)、或(ii-3)表示的基团;

15、[化学式2]

16、

17、式(ii-1)、(ii-2)、或(ii-3)中记载的符号:

18、[化学式3]

19、

20、表示与2’-氨基的键合位点;

21、r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基、可以被1个以上取代基取代的c2-6烯基、可以被1个以上取代基取代的c2-6炔基、或可以被1个以上取代基取代的芳香族基团;

22、a为芳香族基团;

23、m为被选自由可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基及可以被1个以上取代基取代的芳香族基团组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。]

24、(以下,将式(i)表示的化合物或其盐称为“本发明化合物”)。

25、[2]如[1]所述的化合物或其盐,其中,b为可以具有1个以上保护基的腺嘌呤基、可以具有1个以上保护基的鸟嘌呤基、可以具有1个以上保护基的胞嘧啶基、可以具有1个以上保护基的5-甲基胞嘧啶基或可以具有1个以上保护基的尿嘧啶基。

26、[3]如[1]或[2]所述的化合物或其盐,其中,r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子;

27、m为1。

28、[4]如[1]~[3]中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-1)表示的基团;而且,

29、r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基、或可以被1个以上取代基取代的芳香族基团。

30、[5]如[4]所述的化合物或其盐,其中,r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-3烷基。

31、[6]如[5]所述的化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为甲基。

32、[7]如[5]所述的化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为异丙基。

33、[8]如[1]~[3]中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-2)表示的基团;而且,

34、a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的1个以上杂原子。

35、[9]如[8]所述的化合物或其盐,其中,a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的2个或3个杂原子,所述2个或3个杂原子中包括至少2个氮原子,该取代基各自独立地选自由可以被1个以上卤素原子取代的c1-3烷基、卤素原子、及可以被1个以上c1-3烷基取代的氨基组成的组。

36、[10]如[9]所述的化合物或其盐,其中,五元或六元环的杂芳基选自由可以被1个以上取代基取代的、三唑基、噁二唑基、噻二唑基、嘧啶基、及吡嗪基组成的组。

37、[11]如[10]所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的三唑基为1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基。

38、[12]如[10]所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噁二唑基为5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基。

39、[13]如[10]所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噻二唑基为3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基。

40、[14]如[1]~[3]中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-3)表示的基团;而且,

41、m为被选自由可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基及可以被1个以上取代基取代的芳基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

42、[15]如[14]所述的化合物或其盐,其中,m为被选自由甲基及苯基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

43、[16]如[1]~[15]中任一项所述的化合物或其盐,其中,r6为氢原子或dmtr基团,而且,r5为氢原子或-p(o(ch2)2cn)(n(ipr)2)。

44、[17]化合物,其选自由以下的化合物组成的组:

45、3-[[(1r,4r,6r,7s)-4-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-6-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-甲基磺酰基-5-氧杂-2-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物1);

46、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物2);

47、[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-2-(2-甲基丙酰基氨基)嘌呤-6-基]n,n-二苯基氨基甲酸酯(本发明化合物3);

48、n-[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-嘌呤-6-基]苯甲酰胺(本发明化合物4);

49、3-[[(1r,3r,4r,7s)-5-(苯磺酰基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物5);

50、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-5-(苯磺酰基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基)氧基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物6);

51、(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-甲基-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物7);

52、(1r,3r,4r,7s)-3-(4-苯甲酰胺基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-甲基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物8);

53、[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(甲基氨基甲酰基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-2-(2-甲基丙酰基氨基)嘌呤-6-基]n,n-二苯基氨基甲酸酯(本发明化合物9);

54、(1r,3r,4r,7s)-3-(6-苯甲酰胺基嘌呤-9-基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-甲基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物10);

55、(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-异丙基-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物11);

56、(1r,3r,4r,7s)-3-(4-苯甲酰胺基-5-甲基-2-氧代嘧啶-1-基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-异丙基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物12);

57、[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(异丙基氨基甲酰基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-2-(2-甲基丙酰基氨基)嘌呤-6-基]n,n-二苯基氨基甲酸酯(本发明化合物13);

58、(1r,3r,4r,7s)-3-(6-苯甲酰胺基嘌呤-9-基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n-异丙基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物14);

59、(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n,n-二甲基-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物15);

60、(1r,3r,4r,7s)-3-(4-苯甲酰胺基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-n,n-二甲基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺(本发明化合物16);

61、3-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-嘧啶-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物17);

62、1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-嘧啶-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物18);

63、n’-[9-(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-嘧啶-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-6-氧代-1h-嘌呤-2-基]-n,n-二甲基-6-甲脒(本发明化合物19);

64、n’-[9-(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-嘧啶-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]嘌呤-6-基]苯甲酰胺(本发明化合物20);

65、3-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-嘧啶-4-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物21);

66、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-嘧啶-4-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物22);

67、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-[4-(三氟甲基)嘧啶-2-基]-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物23);

68、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-[4-(三氟甲基)嘧啶-2-基]-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物24);

69、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-5-(5-氯嘧啶-2-基)-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物25);

70、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-5-(5-氯嘧啶-2-基)-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物26));

71、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-5-[6-(二甲基氨基)嘧啶-4-基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基胺)膦基]氧基丙腈(本发明化合物27);

72、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-[(6-二甲基氨基)嘧啶-4-基]-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物28);

73、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-5-[2-(二甲基氨基)嘧啶-4-基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)氧基丙腈(本发明化合物29);

74、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-[2-(二甲基氨基)嘧啶-4-基]-7-羟基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物30);

75、3-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-吡嗪-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物31);

76、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-吡嗪-2-基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物32);

77、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-5-(1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基)-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物33);

78、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物34);

79、n’-[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-6-氧代-1h-嘌呤-2-基]-n,n-二甲基-甲脒(本发明化合物35);

80、n-[9-(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]嘌呤-6-基]苯甲酰胺(本发明化合物36);

81、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物37);

82、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物38);

83、3-[[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-3-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-5-(3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基]氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基丙腈(本发明化合物39);

84、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-(3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]苯甲酰胺(本发明化合物40);

85、n-[1-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-羟基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代-嘧啶-4-基]二氢嘧啶-2-酮(本发明化合物41)

86、n’-[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-6-氧代-1h-嘌呤-2-基]-n,n-二甲基甲脒(本发明化合物42);

87、n-[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-(二异丙基氨基)膦基]氧基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-6-氧代-1h-嘌呤-2-基]-2-甲基-丙酰胺(本发明化合物43);以及

88、n-[9-[(1r,3r,4r,7s)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-7-羟基-5-甲基磺酰基-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-6-氧代-1h-嘌呤-2-基]-2-甲基-丙酰胺(本发明化合物44)。

89、(寡核苷酸)

90、[18]寡核苷酸化合物或其盐,其具有1个以上的通式(i’)表示的核苷,

91、[化学式4]

92、

93、[式中,

94、b为可以被1个以上取代基取代的核酸的碱基部分;

95、r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子、或可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基;

96、m为1或2;

97、x为下述式(ii’-1)、(ii’-2)、或(ii’-3)表示的基团;

98、[化学式5]

99、

100、式(ii’-1)、(ii’-2)、或(ii’-3)中记载的符号:

101、[化学式6]

102、

103、表示与2’-氨基的键合位点;

104、a为可以被1个以上取代基取代的芳香族基团,所述芳香族基团包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的1个以上杂原子;

105、m为被选自由可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基及可以被1个以上取代基取代的芳香族基团组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。]

106、(以下,将式(i’)表示的化合物或其盐称为“本发明寡核苷酸化合物”)。

107、[19]如[18]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,b为可以具有1个以上保护基的腺嘌呤基、可以具有1个以上保护基的鸟嘌呤基、可以具有1个以上保护基的胞嘧啶基、可以具有1个以上保护基的5-甲基胞嘧啶基或可以具有1个以上保护基的尿嘧啶基。

108、[20]如[18]或[19]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子;

109、m为1。

110、[21](脲型化合物)

111、[18]~[20]中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-1)表示的基团;而且,

112、r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基、或可以被1个以上取代基取代的芳香族基团。

113、[22]如[21]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-3烷基。

114、[23]如[22]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为甲基。

115、[24]如[23]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为异丙基。

116、[25](芳基型化合物)

117、[18]~[20]中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-2)表示的基团;而且,

118、a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的1个以上杂原子。

119、[26]如[25]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的2个或3个杂原子,所述2个或3个杂原子中包括至少2个氮原子,该取代基各自独立地选自由可以被1个以上卤素原子取代的c1-3烷基、卤素原子、及可以被1个以上c1-3烷基取代的氨基组成的组。

120、[27]如[26]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,五元或六元环的杂芳基选自由可以被1个以上取代基取代的、三唑基、噁二唑基、噻二唑基、嘧啶基、及吡嗪基组成的组。

121、[28]如[27]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的三唑基为1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基。

122、[29]如[27]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噁二唑基为5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基。

123、[30]如[27]所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噻二唑基为3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基。

124、[31](磺酰胺型化合物)

125、[18]~[20]中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-3)表示的基团;而且,

126、m为被选自由可以被1个以上取代基取代的c1-6烷基及可以被1个以上取代基取代的芳基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

127、[32]如[18]~[31]中任一项所述的化合物或其盐,其中,m为被选自由甲基及苯基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

128、[33]经硫化的[18]~[32]中任一项所述的寡核苷酸或其盐,其中,核苷酸间的磷酸键中的至少1个以上为硫代磷酸酯(phosphorothioate)键。

129、发明的效果

130、通过本发明,能制造新型的2’-氨基lna(以下,简称为alna)、及包含这些alna作为单体的低聚物(以下,简称为alna低聚物)。本发明的alna低聚物在体外(in vitro)具有靶微rna的功能抑制活性、强力的靶基因敲低(knock down)活性,另外,在向生物体施予的情况下,在多种器官(例如,肌肉等)中具有强力的靶基因敲低活性,因此,可期待作为新型的核酸药物的应用。


技术特征:

1.通式i表示的化合物或其盐,

2.如权利要求1所述的化合物或其盐,其中,b为可以具有1个以上保护基的腺嘌呤基、可以具有1个以上保护基的鸟嘌呤基、可以具有1个以上保护基的胞嘧啶基、可以具有1个以上保护基的5-甲基胞嘧啶基或可以具有1个以上保护基的尿嘧啶基。

3.如权利要求1或2所述的化合物或其盐,其中,r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子;

4.如权利要求1~3中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-1)表示的基团;而且,

5.如权利要求4所述的化合物或其盐,其中,r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-3烷基。

6.如权利要求5所述的化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为甲基。

7.如权利要求5所述的化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为异丙基。

8.如权利要求1~3中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-2)表示的基团;而且,

9.如权利要求8所述的化合物或其盐,其中,a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的2个或3个杂原子,所述2个或3个杂原子中包括至少2个氮原子,该取代基各自独立地选自由可以被1个以上卤素原子取代的c1-3烷基、卤素原子、及可以被1个以上c1-3烷基取代的氨基组成的组。

10.如权利要求9所述的化合物或其盐,其中,五元或六元环的杂芳基选自由可以被1个以上取代基取代的、三唑基、噁二唑基、噻二唑基、嘧啶基、及吡嗪基组成的组。

11.如权利要求10所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的三唑基为1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基。

12.如权利要求10所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噁二唑基为5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基。

13.如权利要求10所述的化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噻二唑基为3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基。

14.如权利要求1~3中任一项所述的化合物或其盐,其中,x为式(ii-3)表示的基团;而且,

15.如权利要求14所述的化合物或其盐,其中,m为被选自由甲基及苯基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

16.如权利要求1~15中任一项所述的化合物或其盐,其中,r6为氢原子或dmtr基团,而且,r5为氢原子或-p(o(ch2)2cn)(n(ipr)2)。

17.化合物,其选自由以下的化合物组成的组:

18.寡核苷酸化合物或其盐,其具有1个以上的通式(i’)表示的核苷,

19.如权利要求18所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,b为可以具有1个以上保护基的腺嘌呤基、可以具有1个以上保护基的鸟嘌呤基、可以具有1个以上保护基的胞嘧啶基、可以具有1个以上保护基的5-甲基胞嘧啶基或可以具有1个以上保护基的尿嘧啶基。

20.如权利要求18或19所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r1、r2、r3及r4各自独立地为氢原子;

21.如权利要求18~20中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-1)表示的基团;而且,

22.如权利要求21所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8各自独立地为氢原子、可以被1个以上取代基取代的c1-3烷基。

23.如权利要求22所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为甲基。

24.如权利要求23所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,r7及r8中的一者为氢原子,另一者为异丙基。

25.如权利要求18~20中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-2)表示的基团;而且,

26.如权利要求25所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,a为可以被1个以上取代基取代的五元或六元环的杂芳基,所述杂芳基包含选自由氮原子、氧原子及硫原子组成的组中的2个或3个杂原子,所述2个或3个杂原子中包括至少2个氮原子,该取代基各自独立地选自由可以被1个以上卤素原子取代的c1-3烷基、卤素原子、及可以被1个以上c1-3烷基取代的氨基组成的组。

27.如权利要求26所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,五元或六元环的杂芳基选自由可以被1个以上取代基取代的、三唑基、噁二唑基、噻二唑基、嘧啶基、及吡嗪基组成的组。

28.如权利要求27所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的三唑基为1,5-二甲基-1,2,4-三唑-3-基。

29.如权利要求27所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噁二唑基为5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基。

30.如权利要求27所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,可以被1个以上取代基取代的噻二唑基为3-甲基-1,2,4-噻二唑-5-基。

31.如权利要求18~20中任一项所述的寡核苷酸化合物或其盐,其中,x为式(ii’-3)表示的基团;而且,

32.如权利要求18~31中任一项所述的化合物或其盐,其中,m为被选自由甲基及苯基组成的组中的1个取代基取代的磺酰基。

33.经硫化的权利要求1~32中任一项所述的寡核苷酸或其盐,其中,核苷酸间的磷酸键中的至少1个以上为硫代磷酸酯键。


技术总结
本发明涉及桥连型人工核酸ALNA。本发明提供新型的桥连型人工核酸、及包含其作为单体的低聚物。更具体而言,本发明提供通式(I)(式中的各符号与说明书中定义的相同)表示的化合物或其盐;及通式(I’)(式中的各符号与说明书中定义的相同)表示的寡核苷酸化合物或其盐。

技术研发人员:泽本浩昭,熊谷新司,古川博之,荒木友,宇津木雅之,小比贺聪
受保护的技术使用者:田边三菱制药株式会社
技术研发日:
技术公布日:2024/12/17
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