本发明涉及一种预测受试者的侵袭性癌症或复发性癌症概率的风险的方法。具体地，本发明涉及一种预测受试者的侵袭性癌症和受试者的癌症复发的风险的方法。
背景技术：
1、由于对前列腺癌认识的提高、广泛的前列腺特异性抗原(psa)筛查和直肠指检(dre)测试，许多前列腺癌(约60％)在早期被检测到。主要检测到(60％)65岁以上的老年男性。大约80％的患者患有生长缓慢或惰性前列腺癌，并且在经受被称为主动监测的频繁监测时，可以不治疗其疾病。剩余20％的患者患有侵袭性前列腺癌，该侵袭性前列腺癌具有转移到身体另外部位的潜力，并且需要侵袭性治疗。从历史观点上说，大多数前列腺癌患者已经接受了积极的治疗，其中许多患者经受了根治性前列腺切除术，并且结合了放射疗法、激素疗法或化学疗法，由此导致了显著的终生不利副作用。此不必要的过度治疗大大增加了患者和医疗保健系统的成本。当前的临床工具不能确定转移的真实风险，因此准确地鉴定患有侵袭性前列腺癌的患者(即，预测转移潜力)代表了主要的临床未满足需求，并且对于为前列腺癌患者选择适当的治疗方案是至关重要的。
2、前列腺癌是仅次于非黑色素瘤皮肤癌的第二大常见男性癌症(占英国所有男性癌症诊断的26％)，是仅次于肺癌的第二大男性癌症死亡病因，并且是全球第四大流行癌症。全世界每年估计有120万男性被诊断为患有前列腺癌。诊断时的平均年龄是67岁，其中大约25％的病例是65岁以下的男性。由于psa筛查的增加，大多数患者被诊断为患有早期疾病。
3、临床医生和患者面临的主要临床问题是如何最好地治疗前列腺癌；在惰性癌症的病例中，或者如果患者需要对侵袭性癌症进行根治性治疗，则必须决定主动监测是否是适当的临床途径。根治性前列腺切除术和放射疗法使患者暴露于显著的和终生的负面副作用和生活质量问题，这些负面副作用和生活质量问题包含失禁、勃起功能障碍、情绪困扰和抑郁。据统计，80％的男性将患有惰性、生长缓慢的低级别前列腺癌，该低级别前列腺癌可以通过主动监测安全地管理，其中20％的男性需要侵袭性治疗。迄今为止，大约76％的男性被视为患有侵袭性疾病而进行治疗，由此导致不必要的过度治疗，并且使患者暴露于显著的副作用。准确地确定前列腺癌级别、阶段和侵袭性对于适当的患者治疗分层是至关重要的。增加主动监测下男性的数量将(i)减少过度治疗并提高快速治疗高风险疾病的能力，(ii)减少不必要地接受根治性治疗并经历不良反应的男性数量，以及(iii)降低治疗和管理这些不良反应的成本。
4、用于确定受试者中是否存在癌症的生物标志物小组是本领域已知的。例如，wo2015/087088描述了预测侵袭性或复发性前列腺癌的风险的方法，其中mtus1是许多生物标志物中的一种生物标志物。wo2016/042164描述了一种用于预测患有癌症的个体的癌症复发的风险的方法，该方法包括测定来自该个体的癌症样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的阳性表达的步骤，这些基因选自由以下组成的组：foxm1、uhrf1、pttg1、e2f1、mybl2、hmgb2、atad2、e2f8、znf367和tcf19。wo03/078662描述了用于诊断和治疗乳腺癌的用于测量经活检的肿瘤组织中mrna水平的方法。lv daojun等人,(《癌症免疫学免疫疗法(cancer immunology immunotherapy)》,第70卷,第3587-3602页(2021))描述了包含生物标志物tigit的基于免疫相关基因的预后标记(irgps)用于确定高风险前列腺癌受试者的用途。abou-ouf,hatem等人,(《癌症研究和临床肿瘤学杂志(journal of cancerresearch and clinical oncology)》,第144卷,第883-891页(2018))描述了前列腺癌中的10-基因标记，这些基因标记可用于区分低患者风险组和中等患者风险组内的侵袭性和惰性疾病。wo2012/135397描述了一种用于发现任何癌症的生物标志物(生物标志物)的方法，该癌症的生长可能受到线粒体氧化代谢的调节。wo2020/214718用于鉴定与不良预后相关的癌症的方法。wo2015/127101描述了用于诊断侵袭性前列腺癌的方法，该方法包含确定测试样品中编码(foxm1)叉头盒蛋白m1和着丝粒蛋白f(cenpf)的基因中的每个基因的表达水平。
5、本发明的目的是克服上述问题中的至少一个问题。
技术实现思路
1、前列腺癌是仅次于非黑色素瘤皮肤癌的第二大常见男性癌症，是仅次于肺癌的第二大男性癌症死亡病因，并且是全球第四大流行癌症。大约80％的前列腺癌患者具有生长缓慢的癌症，并且可以在经受主动监测的同时安全地不治疗其疾病；而20％的前列腺癌患患有具有高转移潜力的侵袭性癌症，并且需要包含根治性前列腺切除术(rp)结合放射疗法、激素疗法或化学疗法的侵袭性治疗。
2、当前的临床工具不能准确地鉴定患者是否患有侵袭性前列腺癌，因此过度治疗是前列腺癌的临床管理中的主要问题，因为许多患者经受了根治性前列腺切除术，由此导致严重的并发症，这些并发症包含感染、失禁、勃起功能障碍和抑郁。为了区分需要侵袭性治疗的患者和能够安全地经受主动监测的患者，需要准确的预后测试来确定患者的前列腺癌复发的风险，该临床需求尚未得到满足。此类预后测试的发展将减少前列腺癌患者的过度治疗，由此使许多个体免于治疗的大量不利副作用。
3、所要求保护的发明的方法基于测量与癌症进展和侵袭性高度相关的基因表达水平的变化。该测试测量例如前列腺癌的侵袭性和前列腺癌复发的潜力，从而使得能够实现更个性化的治疗策略。
4、该方法是用于评估例如最近诊断为患有前列腺癌的男性的侵袭性疾病的概率的多基因预后标记。使用rt-qpcr测定对从福尔马林固定的、石蜡包埋的(ffpe)前列腺肿瘤组织中提取的rna样品进行测试。那些通过测试被视为处于较低风险类别(即，具有较低风险评分)的人可以安全地放弃即刻确定性治疗，而那些被视为处于较高风险类别(即，较高风险评分)的人可以考虑强化治疗。低风险意指具有较低的侵袭性或复发性疾病风险的人，并且高风险意指具有较高的侵袭性或复发性疾病风险的人。
5、该测试采用了通过将至少两个基因的表达水平相加并将其与参考风险评分进行比较而产生的患者风险评分。每个基因的表达水平通常是归一化的。在一些实施例中，将每个基因的表达水平的函数加在一起，并与参考风险评分进行比较。以下说明书中更详细地列出了实例。
6、该方法可以包括确定来自来自受试者的样品中的一个基因小组的至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的组合表达。该至少两个基因中的每个基因的表达水平针对参考基因(例如，一种或多种管家基因的集合)归一化。然后将归一化表达水平或归一化表达水平的函数(例如，加权归一化表达水平，其中权重是基因特异性的)加在一起，以提供测试风险评分。对对照样品(例如，来自患有非侵袭性癌症的患者或来自无复发受试者的样品)进行相同的练习，以提供参考风险评分。当获得两个结果/评分时，将这两个结果/评分相互比较。当来自测试样品的基因的组合的归一化表达相对于对照样品中的基因的组合的归一化表达改变(增加或减少)时，测试受试者具有更高的侵袭性或复发性疾病的风险。组合是基因的基因特异性加权归一化化表达的相加。
7、提供了一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括：测定从该个体获得的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性癌症的受试者的生物样品中的该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
8、表达值可以是例如拷贝数或拷贝数的函数，如基因特异性加权拷贝数。基因特异性权重可基于特异性基因对侵袭性或复发性表型的风险的相对贡献来确定，该相对贡献如通过分析包含具有良好结果的患者和具有不良结果的患者的癌症患者队列中的基因水平来确定的。在材料和方法章节中的统计分析标题下的tcga队列中描述了此类患者队列的实例。
9、一种预测患有癌症的个体在治疗后癌症复发或进展的风险的方法，该方法包括：测定从该个体获得的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从治疗后没有癌症复发或进展的受试者获得的生物样品的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体在该治疗后癌症复发的风险或癌症进展的风险增加。
10、一方面，该治疗选自主动监测、手术和/或放射疗法、新辅助疗法、辅助全身疗法或其组合。
11、一种确定患有癌症的个体的癌症是否是侵袭性癌症类型的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自未患有侵袭性癌症的受试者的该至少两个基因的归一化基因表达水平的组合改变时，预测该个体患有侵袭性癌症类型的风险增加。
12、一种确定被诊断患有癌症的个体的5年存活率或10年存活率的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从癌症诊断后5年或10年后从该癌症中幸存下来的受试者获得的生物样品的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体的5年存活率或10年存活率降低。
13、一种确定被诊断患有前列腺癌的个体的5年存活率或10年存活率的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从癌症诊断后5年或10年后从该前列腺癌中幸存下来的受试者获得的生物样品的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体的5年存活率或10年存活率降低。
14、一种鉴定适合于用用于预防癌症复发或进展的疗法进行治疗的个体的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用该疗法治疗后相对于施用该疗法治疗前来自相同个体的生物样品中该至少两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，预测该个体不适合于该治疗。应该考虑并向该个体提供不同的治疗，并且在以与上述相同的方式施用该不同的治疗后测定来自该个体的另一个生物样品，以确定该不同的治疗是否合适。如果在施用治疗后，该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于在施用治疗疗法前来自相同个体的生物样品中该至少两个基因的归一化表达值的组合降低，预测该个体适合于该治疗。
15、一种用于监测患有癌症的个体的癌症治疗的有效性的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用该治疗后相对于施用该治疗前来自相同个体的生物样品中该至少两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，该治疗是无效的，并且预测该个体具有不良结果。在此情况下，可以停止治疗方案，并且可以对接受治疗的患有癌症的个体施用新的治疗方案，或者完全停止治疗。如果在施用治疗后，该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于在施用该治疗前来自相同个体的生物样品中该至少两个基因的归一化表达值的组合降低，该治疗是有效的，并且预测该个体具有改善的结果。
16、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括测定从该个体获得的生物样品中至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，该基因选自ttc21b、foxm1、pcna、irf7、ulk1和spag5，其中当与来自癌症是非侵袭性或惰性的受试者的生物样品中该至少一个基因的归一化表达值相比，该至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
17、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括测定从该个体获得的生物样品中至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，该基因选自mcm3、mtus1、gpc1、brip1和cul4a，其中当与来自癌症是非侵袭性或惰性的受试者的生物样品中该至少一个基因的归一化表达值相比，该至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
18、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括：测定从该个体获得的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自ttc21b、foxm1、pcna、irf7、ulk1和spag5，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性癌症的受试者的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
19、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括测定从该个体获得的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达，这些基因选自mcm3、mtus1、brip1、cul4a和gpc1，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性癌症的受试者的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
20、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括测定从该个体获得的生物样品中ttc21b基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，其中当ttc21b基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值相对于来自癌症是非侵袭性或惰性的个体的样品中ttc21b基因的归一化表达值改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
21、一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，该方法包括测定从该个体获得的生物样品中mtus1基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，其中当mtus1基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值相对于来自患有癌症的个体的样品中mtus1基因的归一化表达值改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
22、在一个实施例中，至少一个基因是cul4a。在一个实施例中，至少一个基因是ttc21b。在一个实施例中，至少一个基因是mcm3。在一个实施例中，至少一个基因是gpc1。在一个实施例中，至少一个基因是pcna。在一个实施例中，至少一个基因是mtus1。在一个实施例中，至少一个基因是irf7。在一个实施例中，至少一个基因是brip1。在一个实施例中，至少一个基因是ulk1。在一个实施例中，至少一个基因是spag5。在一个实施例中，至少一个基因是foxm1。
23、在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和ttc21b。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和mcm3。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和pcna。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和mcm3。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和pcna。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和muts1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ttc21b和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和ukl1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是cul4a和foxm1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和ttc21b。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和mcm3。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少两个基因是foxm1和spag5。
24、在一个实施例中，选择至少三个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b和mcm3。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4a、ttc21b和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是ttc21b、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、irf7和brips。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mcm3、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是gpc1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是pcna、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、brip1和ul1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是mtus1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少三个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b和cul4a。在一个实施例中，选择至少三个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b和mcm3。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ttc21b和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是cul4、mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和cul4。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少三个基因是foxm1、ulk1和spag5。
25、在一个实施例中，选择至少四个基因，并且所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、ttc21b、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、mcm3、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是cul4a、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、irf7和ulk。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mcm3、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是ttc21b、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mcm3、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是gpc1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是pcna、mtus1、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是pcna、mtus1、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是pcna、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少四个基因，并且所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和cul4a。在一个实施例中，选择至少四个基因，并且所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和gpc1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mcm3和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、ttc21b、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、mcm3、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少四个基因是foxm1、brip1、ulk1和spag5。
26、在一个实施例中，选择至少五个基因，并且所选择的基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、ttc21b、mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mcm3、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mcm3、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mcm3、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mcm3、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mcm3、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mtus1、irf7、brip1
27、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、mtus1、irf7、brip1
28、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是cul4、irf7、brip1、ulk1
29、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna
30、和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna
31、和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna
32、和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna
33、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna
34、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1
35、和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1
36、和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1
37、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1
38、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7
39、和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7
40、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7
41、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mtus1、irf7、brip1
42、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、mtus1、irf7、brip1
43、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是ttc21b、irf7、brip1、ulk1
44、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1
45、和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1
46、和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1
47、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1
48、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7
49、和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7
50、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7
51、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、mtus1、irf7、brip1
52、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、mtus1、irf7、brip1
53、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mcm3、irf7、brip1、ulk1
54、和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7
55、和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7
56、和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是gpc1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少五个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和cul4。在一个实施例中，选择至少五个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和pcna。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。
57、在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7和spag5。
58、在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mtus1、irf7、brip1和ulk1。
59、在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、mtus1、irf7、brip1和spag5。
60、在一个实施例中，所选择的至少五个基因是foxm1、irf7、brip1、ulk1和spag5。
61、在一个实施例中，选择至少六个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是cul4a、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、gpc1、pcna、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、gpc1、pcna、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是ttc21b、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少六个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和cul4a。在一个实施例中，选择至少六个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和mtus1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和irf7。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少六个基因是foxm1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。
62、在一个实施例中，选择至少七个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是cul4a、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是ttc21b、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少七个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和cul4a。在一个实施例中，选择至少七个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和irf7。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和brip1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少七个基因是foxm1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。
63、在一个实施例中，选择至少八个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，选择至少八个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和cul4a。在一个实施例中，选择至少八个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和brip1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少八个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7和spag5。
64、在一个实施例中，选择至少九个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，选择至少九个基因，并且所选择的基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和cul4a。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少九个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。
65、在一个实施例中，选择至少十个基因，并且所选择的基因是cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和ulk1。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、mcm3、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、ttc21b、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、cul4a、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。在一个实施例中，所选择的至少十个基因是foxm1、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。
66、在一个实施例中，选择ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的全部。
67、在一个实施例中，所选择的至少两个基因是mtus1和ttc21b。
68、在一个实施例中，至少两个基因包括mtus1和ttc21b，并且至少一个另外的基因选自mcm3、foxm1、cul4、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。优选地，至少一个另外的基因是mcm3或foxm1。优选地，至少一个基因是mcm3和另外的foxm1。
69、在一个实施例中，至少两个基因包括mtus1和mcm3，并且至少一个另外的基因选自ttc21b、foxm1、cul4、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。
70、在一个实施例中，至少两个基因包括ttc21b和mcm3，并且至少一个另外的基因选自ttc21b、foxm1、gpc1、cul4、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5。
71、在一个实施例中，选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5的所述至少两个基因是mtus1、ttc21b、mcm3和foxm1。
72、在一个实施例中，所选择的基因由mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1组成。
73、术语“基本上由…组成”应被理解为意指选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5的所有十一个基因、或十个基因、或九个基因、或八个基因、或七个基因、或六个基因、或五个基因、或四个基因、或三个基因或两个基因。
74、在一个实施例中，该癌症选自包括以下的组：多发性骨髓瘤、前列腺癌、胶质母细胞瘤、淋巴瘤、纤维肉瘤；粘液肉瘤；脂肪肉瘤；软骨肉瘤；骨原性肉瘤；脊索瘤；血管肉瘤；内皮肉瘤；淋巴管肉瘤；淋巴管内皮肉瘤(lymphangioendotheliosarcoma)、滑膜瘤；间皮瘤；尤文氏瘤(ewing's tumour)、平滑肌肉瘤；横纹肌肉瘤；结肠癌；胰腺癌；卵巢癌；鳞状细胞癌；基底细胞癌；腺癌；汗腺癌；皮脂腺癌；乳头状癌；乳头状腺癌；囊腺癌；髓样癌；支气管原癌；肾细胞癌；肝细胞瘤；胆管癌；绒毛膜癌；精原细胞瘤、胚胎性癌；维尔姆斯瘤(wilms'tumour)；宫颈癌；子宫癌；睾丸肿瘤；肺癌；小细胞肺癌；膀胱癌；上皮癌；神经胶质瘤；星形细胞瘤；成神经管细胞瘤；颅咽管瘤；室管膜瘤；松果体瘤；成血管细胞瘤；听神经瘤；少突胶质细胞瘤；脑膜瘤；黑色素瘤；视网膜母细胞瘤；以及白血病。合适地，该癌症是上皮癌。
75、在一个实施例中，该癌症是选自以下的前期癌病状：巴雷特食管(barrett'soesophagus)、鲍恩氏病(bowen's disease)、家族性腺瘤性息肉病(fap)、小叶原位癌(lcis)、林奇综合征(lynch syndrome)、men2、阴道上皮内瘤形成(vain)和外阴上皮内瘤形成(vin)。在诊断受试者是否患有侵袭性癌症的风险或患有癌症复发的风险时，包含前期癌病状。
76、在一个实施例中，复发是继发性肿瘤的发展。
77、在一个实施例中，复发发展为与取样的癌症无关的另外的独立的原发性癌症。
78、在本发明的一个实施例中，提供了一种预测患者的前列腺癌复发的风险的方法，该方法包括：其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达相对于该癌症是非侵袭性或惰性受试者的生物样品中该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质归一化基因表达水平改变时，该个体患有复发性前列腺癌症的风险增加。
79、在一个实施例中，该疗法或该治疗是新辅助疗法。在说明书中，术语“新辅助疗法”应被理解为意指在主要治疗之前给予的治疗，以增加长期存活的机会。主要治疗通常是手术。新辅助疗法通常选自化学疗法、激素疗法、靶向疗法、放射疗法、免疫疗法或其组合。
80、在一个实施例中，该疗法是辅助疗法。在说明书中，术语“辅助疗法”应被理解为意指在主要治疗之后给予的任何治疗，以增加长期存活的机会。主要治疗通常是手术。辅助疗法通常选自化学疗法、激素疗法、靶向疗法、放射疗法、免疫疗法或其组合。主动监测也可以被认为是辅助疗法。
81、在一个实施例中，疗法可以是新辅助疗法和辅助疗法的组合。
82、在一个实施例中，疗法可以是主动监测，其中治疗计划涉及密切观察个体的病状，但不给予任何治疗，除非示出病状正在恶化的测试结果有变化。
83、一方面，疗法可以是外科手术(例如，去除原发性肿瘤或继发性肿瘤的外科手术)，或者新辅助疗法和手术的组合；或辅助疗法和手术；或新辅助疗法、手术和辅助疗法。
84、在一个实施例中，癌症患者可适合于用新辅助疗法进行治疗，用于预防癌症的复发或进展。
85、在一个实施例中，癌症是前列腺癌。
86、一方面，辅助疗法和新辅助疗法是化学治疗疗法。在一个实施例中，辅助疗法和新辅助疗法选自环磷酰胺(cyclophosphamide)、甲氨蝶呤(methotrexate)、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)、吉西他滨(gemcitabine)、阿霉素(doxorubicin)(c27h29no11)、紫杉醇(paclitaxel)(c47h51no14)、卡培他滨(capecitabine)(c15h22fn3o6)、多西他赛(docetaxel)(c43h53no14)、卡巴他赛(cabazitaxel)(c45h57no14)、米托蒽醌(mitoxantrone)(c22h28n4o6)和雌莫司汀(estramustine)(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)。
87、一方面，疗法是选择不进行手术、辅助疗法和/或新辅助疗法。
88、在本发明的一个实施例中，提供了一种用于治疗癌症或癌前病状的方法，该方法包括以下步骤：通过测定来自个体的生物样品中至少两个选自由以下组成的组的基因的表达：ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，来鉴定癌症复发潜力增加的个体，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达相对于来自从癌症是非侵袭性或惰性的受试者获得的生物样品的该至少两个基因的归一化基因表达水平改变时，该个体患有复发性癌症的风险增加；以及
89、用治疗有效量的辅助疗法治疗该个体。
90、在一个实施例中，用治疗有效量的新辅助疗法治疗个体。
91、在本发明的一个实施例中，提供了一种用于治疗癌症或癌前病状的方法，该方法包括以下步骤：通过测定来自个体的生物样品中至少两个选自由以下组成的组的基因的表达：ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，来鉴定癌症复发潜力增加的个体，其中当该至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从患有癌症的受试者获得的生物样品的该至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体患有复发性癌症的风险增加；以及
92、用治疗有效量的新辅助疗法治疗该个体。
93、在一个实施例中，用治疗有效量的辅助疗法治疗个体。
94、在一个实施例中，用主动监测来跟踪个体。
95、在一个实施例中，新辅助疗法和辅助疗法是选自但不限于选自以下的化学治疗药物的药剂：环磷酰胺、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、阿霉素(c27h29no11)、紫杉醇(c47h51no14)、卡培他滨(c15h22fn3o6)、多西他赛(c43h53no14)、卡巴他赛(c45h57no14)、米托蒽醌(c22h28n4o6)和雌莫司汀(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)以及促黄体激素释放(lhrh)激动剂，这些lhrh激动剂选自亮丙瑞林(c59h84n16o12)、戈舍瑞林(c59h84n18o14)、曲普瑞林(c64h82n18o13)、甲磺酸亮丙瑞林(c60h88n16o15s)、地加瑞克(c82h103cln18o16)以及瑞卢戈利(c29h27f2n7o5s)。
96、本发明还涉及一种治疗个体以预防或抑制癌症复发的方法，该方法包括以下步骤：使用本发明的方法鉴定具有复发风险的癌症患者，并且然后用一种或多种药剂治疗该癌症患者以预防或抑制癌症复发。通常，一种或多种药剂包括辅助或新辅助疗法，或两者的组合。
97、在一个实施例中，提供了一种用于从从至少一个个体获得的至少一个测试样品获得数据的系统，该系统包括：测定模块，该测定模块被配置成接收至少一个测试样品并对该测试样品进行至少一种测试分析，以测定至少三个基因或由选自以下的这些基因编码的蛋白质的表达：ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，任选地，储存系统，该储存系统用于储存由该测定模块产生的表达数据；以及显示模块，该显示模块用于显示部分基于从所述测定模块输出的数据的内容，其中该内容包括指示至少三个基因或由这些基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合的信号。
98、在一个实施例中，至少三个基因或由所述基因编码的蛋白质是ttc21b、mtus1和mcm3。
99、在一个实施例中，提供了一种预测患者的癌症复发或进展的风险，并用用于预防癌症复发的疗法治疗该患者的方法，该方法包括测定来自该患者的生物样品中至少四个选自以下的基因的表达的步骤：ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5；其中当该至少四个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于从无癌症的受试者获得的样品中该至少四个基因的归一化表达值的组合改变时，个体向该患者施用新辅助或辅助疗法或两者的组合，以预防癌症的复发或进展。
100、在一个实施例中，至少四个基因或由所述基因编码的蛋白质是ttc21b、mtus1、mcm3和foxm1。
101、如本文所描述的，在患有癌症的受试者中，并且尤其是在患有前列腺癌的受试者中，ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的水平可以被改变或失调。因此，在实施例中的任何实施例的一个方面中，本文描述了一种治疗有需要的受试者的癌症或癌前病状的方法，该方法包括被确定具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变的受试者施用局部疗法(手术、放射疗法或两者)、新辅助疗法、辅助全身疗法或其组合。在实施例中的任何实施例的一个方面中，本文描述了一种治疗有需要的受试者的前列腺癌的方法，该方法包括：a)确定从受试者获得的生物样品中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的水平；以及b)如果ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变，则向受试者施用。疗法可以选自手术和放射疗法；和/或激素疗法、化学疗法和/或免疫疗法或其组合。一方面，疗法可以是外科手术(例如，去除原发性肿瘤或继发性肿瘤的外科手术)，或者新辅助疗法和手术的组合；或辅助疗法和手术；或新辅助疗法、手术和辅助疗法。还可以包含主动监测。
102、一方面，辅助疗法和新辅助疗法是化学治疗疗法。在一个实施例中，辅助疗法和新辅助疗法选自环磷酰胺、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、阿霉素(c27h29no11)、紫杉醇(c47h51no14)、卡培他滨(c15h22fn3o6)、多西他赛(c43h53no14)、卡巴他赛(c45h57no14)、米托蒽醌(c22h28n4o6)和雌莫司汀(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)。
103、在一个实施例中，所选择的基因是mtus1和ttc21b、mtus1和mcm3、mcm3和ttc21b、或mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1。
104、在各方面中的任何方面的一些实施例中，该方法包括向先前被确定为具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合的受试者施用，该组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变或失调。在各方面中的任何方面的一些实施例中，本文描述了一种治疗有需要的受试者的前列腺癌的方法，该方法包括：a)首先确定从受试者获得的生物样品中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合；以及b)如果ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变或失调，则然后向受试者施用局部疗法(手术、放射疗法或两者)、新辅助疗法、辅助全身疗法或其组合。
105、在一个实施例中，所选择的基因是mtus1和ttc21b、mtus1和mcm3、mcm3和ttc21b、或mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1。
106、在实施例中的任何实施例的一个方面中，本文描述了一种治疗有需要的受试者的癌症或癌前病状的方法，该方法包括：a)确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的改变的或失调的组合；以及b)如果ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变或失调，则向受试者施用局部疗法(手术、放射疗法或两者)、新辅助疗法、辅助全身疗法或其组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的改变的或失调的组合的步骤可以包括(i)从受试者获得或已经获得生物样品，以及(ii)对从受试者获得的生物样品进行或已经进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的步骤可以包括对从受试者获得的生物样品进行或已经进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的步骤可以包括命令或请求对从受试者获得的生物样品进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的步骤可以包括接收从受试者获得的生物样品的测定结果，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的步骤可以包括接收报告、结果或将受试者鉴定为具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的受试者的其它方法。在一个实施例中，所选择的基因是mtus1和ttc21b、mtus1和mcm3、mcm3和ttc21b、或mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1。
107、在实施例中的任何实施例的一个方面中，本文描述了一种治疗有需要的受试者的前列腺癌的方法，该方法包括：a)确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的改变的或失调的组合；以及b)如果ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变或失调，则指示或指导受试者施用局部疗法(手术、放射疗法或两者)、新辅助疗法、辅助全身疗法或其组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的改变的或失调的组合的步骤可以包括(i)从受试者获得或已经获得生物样品，以及(ii)对从受试者获得的生物样品进行或已经进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达值的步骤可以包括对从受试者获得的生物样品进行或已经进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，确定受试者是否具有ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的改变的或失调的表达水平的步骤可以包括命令或请求对从受试者获得的生物样品进行测定，以确定/测量受试者中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，指示或指导受试者施用特定治疗的步骤可以包括提供测定结果的报告。在各方面中的任何方面的一些实施例中，指示或指导受试者施用特定治疗的步骤可以包括提供测定结果的报告和/或鉴于测定结果的治疗建议。在一个实施例中，所选择的基因是mtus1和ttc21b、mtus1和mcm3、mcm3和ttc21b、或mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1。
108、在实施例中的任何实施例的一个方面中，本文描述了一种确定受试者是否患有癌症或需要癌症治疗的方法，该方法包括：确定从受试者获得的生物样品中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的表达，其中ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1和spag5中的一个或多个的归一化表达值的组合相对于参考样品中的归一化表达值的组合改变或失调，从而表明预测受试者患有癌症或预测受试者需要癌症治疗。一方面，癌症是前列腺癌。在一个实施例中，所选择的基因是mtus1和ttc21b、mtus1和mcm3、mcm3和ttc21b、或mcm3、mtus1、ttc21b和foxm1。
109、一方面，存在一种预测个体的侵袭性或复发性前列腺癌的风险的方法，该方法包括测定来自该个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，其中当这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性前列腺癌的受试者的生物样品中的这两个基因或由所述编码的蛋白质的归一化表达值的组合改变时，预测该个体患有侵袭性或复发性前列腺癌的风险增加。
110、一方面，存在一种预测患有前列腺癌的个体在治疗后前列腺癌复发或进展的风险的方法，该方法包括：测定从该个体获得的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达，其中当这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从治疗后没有前列腺癌复发或进展的受试者获得的生物样品的这两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体在该治疗后前列腺癌复发的风险或前列腺癌进展的风险增加。
111、一方面，存在一种确定被诊断患有前列腺癌的个体的5年存活率或10年存活率的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从前列腺癌诊断后5年或10年后从前列腺癌中幸存下来的受试者获得的生物样品的这两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测该个体的5年存活率或10年存活率降低。
112、一方面，存在一种鉴定适合于用用于预防前列腺癌复发或进展的疗法进行治疗的前列腺癌患者的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中两个基因或由这些基因ttc21b和mtus1编码的蛋白质的表达，其中当这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用该疗法治疗后相对于施用该疗法治疗前来自相同个体的生物样品中这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相同或增加时，预测该个体不适合于该疗法治疗。
113、一方面，存在一种用于监测患有前列腺癌的个体的前列腺癌治疗的有效性的方法，该方法包括：测定来自该个体的生物样品中两个基因或由这些基因ttc21b和mtus1编码的蛋白质的表达，其中当这两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用该治疗后相对于施用该治疗前来自相同个体的生物样品中这两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，该治疗是无效的，并且预测该个体具有不良结果。
114、一方面，该方法进一步包括测定来自该个体的该生物样品中至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，该基因选自mcm3、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。优选地，所选择的该至少一个基因是mcm3。一方面，该方法进一步包括测定来自该个体的该生物样品中至少两个基因的表达的步骤，该至少两个基因选自cul4a、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1、spag5和foxm1。优选地，该至少两个基因是mcm3和foxm1。
115、在各方面中的任何方面的一些实施例中，靶标的表达值的测量和/或靶标(例如，表达产物(本文所描述的基因中的一个基因的核酸或多肽)或突变)的表达值检测或存在可以包括转化。如本文所使用的，术语“转化(transforming)”或“转化(transformation)”是指将例如生物样品、核酸或蛋白质等物体或物质变成另一种物质。该转化可以是物理的、生物的或化学的。示例性物理转化包含但不限于生物样品的预处理，例如，通过差速离心从全血转化为血清。生物/化学转化可以涉及反应中至少一种酶和/或化学试剂的作用。例如，dna样品可以被一种或多种限制性酶消化成片段，或者可以用连接酶将外源性分子与片段化的dna样品连接。在各方面中的任何方面的一些实施例中，dna样品可以经受酶促复制，例如通过聚合酶链式反应(pcr)。
116、靶分子(例如，基因、核苷酸、mrna或多肽)的转化、测量和/或检测可以包括使从受试者获得的样品与对靶标具有特异性的试剂(例如，检测试剂)(例如，靶特异性试剂)接触。在各方面中的任何方面的一些实施例中，靶特异性试剂被可检测地标记。在各方面中的任何方面的一些实施例中，靶特异性试剂可以产生可检测信号。在各方面中的任何方面的一些实施例中，当靶分子存在时，靶特异性试剂产生可检测信号。
117、用于测量基因表达产物的方法是技术人员已知的。此类用于测量基因表达产物(例如，蛋白质水平)的方法包含elisa(酶联免疫吸附测定)、蛋白质印迹、免疫沉淀和使用检测试剂(如抗体或蛋白质结合剂)的免疫荧光。可替代地，可以通过将经标记的抗肽抗体和其它类型的检测剂引入到受试者中来检测受试者体内的肽。例如，抗体可以用可检测标志物标记，该可检测标志物在受试者体内的存在和定位通过标准成像技术来检测。
118、例如，本文所描述的各种靶标的抗体是可商购获得的，并且可以用于本发明的目的，以测量蛋白质表达水平，例如，抗foxm1(密理博西格玛/默克集团，目录号sab1412254)、抗pttg1(密理博西格玛/默克集团，目录号wh0009232m1)、抗znf367(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa015785)、抗ager(密理博西格玛/默克集团，目录号av41642)、抗cul4a(密理博西格玛/默克集团，目录号sab1411512)、抗ttc21b(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa035495)、抗mcm3(密理博西格玛/默克集团，目录号sab1412669)、抗gpc1(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa030571)、抗pcna(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa030521)、抗mtus1(密理博西格玛/默克集团，目录号wh0057509m1)、抗irf7(密理博西格玛/默克集团，目录号prs3941)、抗brip1(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa005474)、抗ulk1(密理博西格玛/默克集团，目录号wh0008408m1)和抗spag5(密理博西格玛/默克集团，目录号hpa022479)。可替代地，由于本文所描述的靶标的氨基酸序列是已知的，并且可在ncbi网站上公开获得，因此本领域技术人员可以出于本文所描述的方法的目的产生其自身针对这些所关注的多肽的抗体。
119、在各方面中的任何方面的一些实施例中，可以使用免疫组织化学(“ihc”)和免疫细胞化学(“icc”)技术。ihc将免疫化学应用于组织切片，而icc是在细胞或组织印片经受特定的细胞学制备(例如，基于液体的制备)后将免疫化学应用于这些细胞或组织印片。免疫化学是基于使用抗体的一系列技术，其中抗体用于特异性地靶向细胞内部或细胞表面上的分子。抗体通常含有标志物，当遇到靶向分子时，该标记物将经受生物化学反应，并且由此经历颜色的变化。在一些情况下，信号扩增可以被整合到特定方案中，其中包含标志物染色或标志物信号的次级抗体跟随初级特异性抗体的应用。
120、在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定可以是蛋白质印迹分析。可替代地，蛋白质可以通过二维凝胶电泳系统分离。二维凝胶电泳在本领域是众所周知的，并且通常涉及沿第一维度的等电聚焦，随后是沿第二维度的sds-page电泳。这些方法也需要大量的细胞材料。2d sds-page凝胶的分析可以通过测定凝胶上蛋白质斑点的强度来进行，或者可以使用免疫检测来进行。在其它实施例中，通过质谱法分析蛋白质样品。
121、免疫测试可以与本文所描述的方法和测定一起使用，并且包含例如使用技术的竞争性和非竞争性测定系统，这些技术如蛋白质印迹、放射免疫测定(ria)、elisa(酶联免疫吸附测定)、“夹心”免疫测定、免疫沉淀测定、免疫扩散测定、凝集测定(例如，胶乳凝集)、补体结合测定、免疫放射测定、荧光免疫测定(例如，fia(荧光连接免疫测定))、化学发光免疫测定(clia)、电化学发光免疫测定(eclia、计数免疫测定(cia))、侧向流动测试或免疫测定(lfia)、磁免疫测定(mia)和蛋白a免疫测定。只要有适当的抗体试剂可用，则用于进行此类测定的方法是本领域已知的。在各方面中的任何方面的一些实施例中，免疫测定可以是定量或半定量免疫测定。
122、免疫测定是生物化学测试，该生物化学测试使用一种或多种抗体与其抗原的相互作用来测量生物样品(通常是如血液或血清等流体样品)中物质的浓度。测定充分利用了抗体与其抗原的高度特异性结合。对于本文所描述的方法和测定，靶多肽与相应的蛋白质或蛋白质片段、或分离的肽、或本文所描述的融合蛋白的特异性结合发生在免疫测定中，以形成靶蛋白/肽复合物。然后通过本领域已知的多种方法检测复合物。免疫测定还经常涉及检测抗体的使用。
123、酶联免疫吸附测定也称为elisa、酶免疫测定或eia，是一种主要用于免疫学的生物化学技术，以检测样品中抗体或抗原的存在。elisa已被用作医学和植物病理学中的诊断工具，以及各种工业中的质量控制检查。
124、在一个实施例中，还可以进行涉及至少一种对所期望的抗原(例如，如本文所描述的靶标中的任何靶标)具有特异性的抗体的elisa。已知量的样品和/或抗原被固定在固相载体(通常是聚苯乙烯微量滴定板)上。固定可以是非特异性的(例如，通过吸附到表面)或特异性的(例如，固定在表面上的另一种抗体用于捕获抗原或初级抗体)。抗原固定后，添加检测抗体，从而与抗原形成复合物。检测抗体可以与酶共价连接，或者本身可以通过次级抗体检测到，该次级抗体通过生物缀合与酶连接。在每个步骤之间通常用将板用温和洗涤剂溶液洗涤以去除任何非特异性结合的蛋白质或抗体。在最后的洗涤步骤之后，通过添加酶促底物来使板显色以产生可见信号，该可见信号指示样品中抗原的数量。旧的elisa利用显色底物，尽管新的测定使用灵敏度高得多的荧光底物。
125、在另一个实施例中，使用竞争性elisa。将针对靶多肽或其片段的经纯化的抗体包被在多孔板的固相上，即与固体表面缀合。还需要第二批未缀合在任何固相载体上的经纯化的抗体。这些未缀合的经纯化的抗体被标记以用于检测目的，例如，用辣根过氧化物酶标记以产生可检测信号。将来自受试者的样品(例如，血液样品)与已知量的所期望的抗原(例如，已知体积或浓度的包括靶多肽的样品)以及辣根过氧化物酶标记的抗体混合，并且然后将混合物添加到包被的孔中以形成竞争性组合。温育后，如果样品中多肽水平高，将形成经标记的抗体试剂-抗原的复合物。此复合物在溶液中是游离的，并且可以洗掉。洗涤孔将去除复合物。然后将孔与tmb(3,3',5,5'-四甲基亚苯基)显色底物一起温育，以定位孔中的辣根过氧化物酶缀合的抗体。如果样品中的靶多肽水平高，则没有颜色变化或颜色变化很小。如果样品中存在很少靶多肽或没有靶多肽，则形成不同的复合物，即固相载体结合的抗体试剂-靶多肽的复合物。此复合物被固定在板上，并且在洗涤步骤中不会被洗掉。随后与tmb一起温育将产生显著的颜色变化。此类竞争性elsa测试是特异的、灵敏的、可重复的，并且易于操作。
126、还有本领域技术人员众所周知的其它不同形式的elisa。本领域已知的elisa的标准技术描述于“《免疫诊断方法(methods in immunodiagnosis)》”,第2版,rose和bigazzi编辑约翰威立父子公司(john wiley&sons),1980；以及oellerich,m.1984,《临床化学和临床生物化学杂志(j.clin.chem.clin.biochem.)》22:895-904。这些参考文献特此通过引用整体并入。
127、在一个实施例中，样品中多肽的水平可以通过侧向流动免疫测定测试(lfia)(也称为免疫色谱测定或条测试(strip test))来检测。lfia是一种旨在检测流体样品中抗原(例如多肽)的存在(或不存在)的简单的装置。当前存在许多用于医学诊断的lfia测试，该lfia测试用于家庭测试、护理点测试或实验室使用。lfia测试是一种免疫测定形式，其中测试样品通过毛细管作用沿固体底物流动。在样品被施加到测试条之后，其遇到与微粒结合的有色试剂(通常包括对测试靶抗原具有特异性的抗体),该微粒与样品混合并且穿过底物，从而遇到已经用另一种抗体或抗原预处理的线或区域。根据样品中存在的靶多肽的水平，有色试剂可以被捕获并且在测试线或区域处结合。lfia本质上是适于沿单轴线操作的免疫测定，以适应测试条格式或试纸格式。条测试是非常通用的，并且可以被本领域技术人员容易地修改，以用于检测来自如尿液、血液、水和/或均质化组织样品等流体样品的大量抗原。条测试也称为浸棒测试，这个名字来源于将测试条“浸”入待测试液体样品的字面意思。lfia条测试易于使用，需要最少的训练，并且可以很容易地作为现场护理点测试(poct)诊断的组成部分在现场使用。lfia测试可作为竞争性或夹心测定进行操作。夹心lfia类似于夹心elisa。样品首先遇到有色颗粒，这些有色颗粒用针对靶抗原的抗体标记。测试线也将含有针对相同靶标的抗体，尽管其可以与抗原上的不同表位结合。在阳性样品中，测试线将示出为有色带。在各方面中的任何方面的一些实施例中，侧向流动免疫测定可以是双抗体夹心测定、竞争性测定、定量测定或其变体。竞争性lfia类似于竞争性elisa。样品首先遇到用靶抗原或类似物标记的有色颗粒。测试线含有针对靶标/其类似物的抗体。样品中未经标记的抗原将阻断抗体上的结合位点，从而预防有色颗粒的摄取。在阴性样品中，测试线将示出为有色带。侧向流动技术存在若干种变体。还可能应用多个捕获区域来创建多重测试。
128、在许多抗原生物标志物的免疫测定的背景下，本领域已经描述了“浸棒”或lfia测试条和其它固相载体的使用。美国专利第4,943,522号；第6,485,982号；第6,187,598号；第5,770,460号；第5,622,871号；第6,565,808号；美国专利申请序列号10/278,676；美国序列号09/579,673；美国序列号10/717,082(这些文献通过引用整体并入本文)是此类侧向流动测试装置的非限制性实例。描述使用“浸棒”技术通过免疫化学测定检测可溶性抗原的专利的实例包含但不限于美国专利第4,444,880号；第4,305,924号；以及第4,135,884号；这些美国专利通过引用整体并入本文。这三个专利的设备和方法广泛地描述了固定在“浸棒”上的固体表面的第一组分，在检测棒上的组分-抗原复合物之前，该浸棒暴露于含有与固定在“浸棒”上的组分结合的可溶性抗原的溶液中。本领域技术人员有能力修改此“浸棒”技术的教导，以使用本文所描述的抗体试剂检测多肽。
129、其它技术可用于检测样品中多肽的水平。一种此类技术是斑点印迹，即蛋白质印迹的改进(towbin等人,《美国国家科学院院刊(proc.nat.acad.sci.)》76:4350(1979))。在蛋白质印迹中，多肽或其片段可以用洗涤剂解离并加热，并在sds-page凝胶上分离，然后再转移到如硝酸纤维素或pvdf膜等固相载体上。将膜与对靶多肽或其片段具有特异性的抗体试剂一起温育。然后将膜洗涤以去除未结合的蛋白质和具有非特异性结合的蛋白质。然后，可检测标记的酶联次级抗体或检测抗体可用于检测和评估经测试的样品中的多肽的量。斑点印迹将蛋白质样品固定在载体的限定区上，然后用抗体和经标记的次级抗体探测，如在蛋白质印迹中。来自任一格式的可检测标记的信号强度对应于存在的酶的量，并且因此对应于多肽的量。可以例如通过光密度测定法定量水平。
130、在各方面中的任何方面的一些实施例中，通过非限制性实例，可以通过以下测量靶标的水平：蛋白质印迹；免疫沉淀；酶联免疫吸附测定(elisa)；放射免疫测定(ria)；夹心测定；荧光原位杂交(fish)；免疫组织化学染色；放射免疫测定；免疫荧光；显色测定；质谱法和/或免疫电泳测定。
131、在某些实施例中，可以通过测定本文所描述的基因的信使rna(mrna)表达水平来测定本文所描述的基因表达产物。此类分子可以从生物样品(如血液样品)中分离、衍生或扩增。用于检测mrna表达的技术是本领域技术人员已知的，并且可以包含但不限于pcr程序、rt-pcr、定量rt-pcr、northern印迹分析、差异基因表达、rna酶保护测定、基于微阵列的分析、下一代测序、杂交方法等。
132、一般而言，pcr程序描述了一种基因扩增的方法，该方法包括(i)引物与核酸样品或文库中的特异性基因或序列的序列特异性杂交，(ii)随后涉及使用热稳定dna聚合酶的多轮退火、延伸和变性的扩增，以及(iii)筛选pcr产物中正确大小的条带。所使用的引物是具有足够长度和适当序列的寡核苷酸，以提供聚合的起始，即每种引物被专门设计成与待扩增的基因组基因座的一条链互补。在替代性实施例中，本文所描述的基因表达产物的mrna水平可以通过逆转录(rt)pcr和定量rt-pcr(qrt-pcr)或实时pcr方法来测定。rt-pcr和qrt-pcr的方法是本领域众所周知的。
133、在各方面中的任何方面的一些实施例中，mrna的水平可以通过定量测序技术(例如，定量下一代测序技术)来测量。核酸序列的测序方法是本领域众所周知的。简而言之，从受试者获得的样品可以与一种或多种引物接触，该一种或多种引物与侧接靶基因序列的单链核酸序列特异性杂交，并合成互补链。在一些下一代技术中，将衔接子(双链或单链)与样品中的核酸分子连接，并且从衔接子或衔接子相容引物开始合成。在一些第三代技术中，可以例如通过确定探针杂交的位置和模式或者通过当单个分子通过传感器时测量该单个分子的一种或多种特性(例如，当核酸分子通过纳米孔时电场的调制)来确定序列。测序的示例性方法包含但不限于桑格测序(sanger sequencing)、双脱氧链终止、高通量测序、下一代测序、454测序、solid测序、polony测序、因美纳测序(illumina sequencing)、离子激流测序、杂交测序、纳米孔测序、helioscope测序、单分子实时测序、rnap测序等。进行这些测序方法的方法和方案是本领域已知的，参见例如，“下一代基因组测序(next generationgenome sequencing)”michal janitz,wiley-vch编辑；“高通量下一代测序(high-throughput next generation sequencing)”kwon和ricke编辑,胡马纳出版社(humannapress),2011；以及sambrook等人,《分子克隆：实验室手册(molecular cloning:alaboratory manual)》(第4版),美国纽约冷泉港的冷泉港实验室出版社(cold springharbor laboratory press,cold spring harbor,n.y.,usa)(2012)；这些文献通过引用以其整体并入本文。
134、本文所描述的基因的核酸序列已被分配了不同物种(如人、小鼠和大鼠)的ncbi登录号。例如，人ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5、核酸序列(例如，seq id no:1-11)和mrna是已知的。类似地，癌症参考标志物alas1、mmadhc、ppp2ca、tfrc和cltc的ncbi登录号也是已知的(例如，seq id no:12-16)。因此，技术人员可以基于用于测定相应基因的核酸或mrna水平的已知序列设计合适的引物。
135、核酸和核糖核酸(rna)分子可以使用本领域众所周知的许多程序中的任何程序从特定生物样品中分离出来，所选择的特定分离程序适用于特定的生物样品。例如，冻融和碱裂解程序可用于从固体材料中获得核酸分子；热和碱裂解程序可用于从尿液中获得核酸分子；并且蛋白酶k提取可用于从血液中获得核酸(roiff,a等人,《pcr：临床诊断和研究(pcr:clinical diagnostics and research)》,springer(1994))。
136、在各方面中的任何方面的一些实施例中，本文所描述的一种或多种试剂(例如，抗体试剂和/或核酸探针)可以包括可检测标记和/或包括产生可检测信号的能力(例如，通过催化将化合物转化为可检测产物的反应)。可检测标记可以包括例如吸光染料、荧光染料或放射性标记。可检测标记、检测这些可检测标记的方法以及将这些可检测标记并入到试剂(例如，抗体和核酸探针)的方法在本领域是众所周知的。
137、在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记可以包含可通过光谱、光化学、生物化学、免疫化学、电磁、放射化学或化学方法(如荧光、化学荧光或化学发光，或任何其它适当的方法)检测的标记。本文所描述的方法中使用的可检测标记可以是初级标记(其中标记包括可直接检测的部分或产生可直接检测的部分)或次级标记(其中可检测标记与另一部分结合以产生可检测信号，例如，如在使用次级抗体和三级抗体的免疫学标记中是常见的)。可检测标记可以通过共价或非共价方法与试剂连接。可替代地，可检测标记可以如通过直接标记分子被连接，该分子通过配体-受体结合对布置或其它此类特异性识别分子实现与试剂的结合。可检测标记可以包含但不限于放射性同位素、生物发光化合物、发色团、抗体、化学发光化合物、荧光化合物、金属螯合物和酶。
138、在其它实施例中，检测试剂用荧光化合物标记。当荧光标记的试剂暴露于适当波长的光时，该荧光标记的试剂的存在可以通过荧光检测到。在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记可以是荧光染料分子或荧光团，该荧光团包含但不限于荧光素、藻红蛋白、藻蓝蛋白、邻苯二甲醛、荧光胺、cy3tm、cy5tm、别藻蓝蛋白(allophycocyanine)、德克萨斯红(texas red)、多甲藻素叶绿素(peridinin chlorophyll)、花青、串联缀合物(如藻红蛋白-cy5tm)、绿色荧光蛋白、罗丹明、异硫氰酸荧光素(fitc)和oregon greentm、罗丹明和衍生物(例如，德克萨斯红和异硫氰酸四罗丹明(tritc))、生物素、藻红蛋白、amca、cydyestm、6-羧基荧光素(通常缩写为fam和f)、6-羧基-2',4',7',4,7-六氯荧光素(hex)、6-羧基-4',5'-二氯-2',7'-二甲氧基荧光素(joe或j)、n,n,n',n'-四甲基-6羧基罗丹明(tamra或t)、6-羧基-x-罗丹明(rox或r)、5-羧基罗丹明-6g(r6g5或g5)、6-羧基罗丹明-6g(r6g6或g6)和罗丹明110；花青染料(例如，cy3、cy5和cy7染料)；香豆素(例如，伞形酮(umbelliferone))；苯甲酰胺染料(例如，hoechst 33258)；菲啶染料(例如，德克萨斯红)；乙锭染料；吖啶染料；咔唑染料；吩噁嗪染料；卟啉染料；聚甲炔染料(例如，花青染料，如cy3、cy5等)；bodipy染料和喹啉染料。在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记可以是放射性标记，包含但不限于3h、125i、35s、14c、32p和33p。在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记可以是酶，该酶包含但不限于辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶。酶促标记可以产生例如化学发光信号、颜色信号或荧光信号。预期用于可检测地标记抗体试剂的酶包含但不限于苹果酸脱氢酶、葡萄球菌核酸酶、δ-v-类固醇异构酶、酵母醇脱氢酶、α-甘油磷酸脱氢酶、磷酸丙糖异构酶、辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、天冬酰胺酶、葡萄糖氧化酶、β-半乳糖苷酶、核糖核酸酶、尿素酶、过氧化氢酶、葡萄糖-vi-磷酸脱氢酶、葡糖淀粉酶和乙酰胆碱酯酶。在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记是化学发光标记，该化学发光标记包含但不限于光泽精(lucigenin)、鲁米诺(luminol)、荧光素、异鲁米诺、热吖啶酯、咪唑、吖啶盐和草酸酯。在各方面中的任何方面的一些实施例中，可检测标记可以是光谱比色标记，该光谱比色标记包含但不限于胶体金或有色玻璃或塑料(例如，聚苯乙烯、聚丙烯和乳胶)珠。
139、在各方面中的任何方面的一些实施例中，检测试剂也可以用可检测标签(如c-myc、ha、vsv-g、hsv、flag、v5、his或生物素)标记。也可以使用其它检测系统，例如，生物素-链霉亲和素系统。在此系统中，与所关注的生物标志物免疫反应(即，具有特异性)的抗体被生物素化。使用链霉亲和素-过氧化物酶缀合物和显色底物来确定与生物标志物结合的生物素化抗体的数量。此类链霉亲和素过氧化物酶检测试剂盒是可商购获得的，例如，来自加利福尼亚州卡平特里亚的达科公司(dako；carpinteria,ca)。试剂也可以使用荧光发射金属(如152eu)或镧系元素的其它金属可检测地标记。这些金属可以使用如二亚乙基三胺五乙酸(dtpa)或乙二胺四乙酸(edta)等金属螯合基团与试剂连接。
140、低于参考表达值或参考风险评分的表达值或风险评分可以是相对于参考表达值或参考风险评分低至少约10％、至少约20％、至少约50％、至少约60％、至少约80％、至少约90％或更少的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，小于参考表达值或风险评分的表达值或风险评分可以是统计学上显著小于参考表达值或风险评分的表达值或风险评分。
141、大于参考表达值或参考风险评分的表达值或风险评分可以是比参考表达值或参考风险评分大至少约10％、至少约20％、至少约50％、至少约60％、至少约80％、至少约90％、至少约100％、至少约200％、至少约300％、至少约500％或更多或更少的表达值或风险评分。在各方面中的任何方面的一些实施例中，大于或小于参考表达值或参考风险评分的表达值或风险评分可以是统计学上显著大于参考表达值或参考风险评分的表达值或风险评分。
142、在各方面中的任何方面的一些实施例中，参考可以是未患有或未被诊断为患有和/或未表现出癌症迹象或症状的受试者群体中靶分子的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，参考也可以是对照样品、对照个体的汇集的样品中靶分子的表达值或基于该表达值的数值或值的范围。在各方面中的任何方面的一些实施例中，参考可以是在较早的时间点从同一受试者获得的样品中靶分子的表达值，例如，本文所描述的方法可以用于确定受试者对给定疗法的灵敏度或应答是否随着时间的推移变化。
143、在一些方面，当使用基因表达水平的组合来确定患有癌症或已被诊断为患有癌症的受试者、或怀疑患有癌症的受试者、或正在接受癌症治疗的受试者的结果或采取的方向时，可以使用风险评分。癌症患者中基因增加或减少的“作用方向”基于不良病理学(ap)结果的单个基因模型。然而，当标记中存在多个基因(2个或更多个)时，基因表达水平方向的作用可能会改变(也称为改变的表达)。对任何基因组合都准确并且隐含作用方向的更一般的描述是使用风险评分(与改变的表达相关)。为了计算风险评分，使用多个基因的归一化表达值的加权线性组合来计算任何基因组合的风险评分。风险评分估计例如侵袭性癌症的概率；风险评分的值越大则指示患侵袭性癌症的可能性就越高，并且反之亦然。这同样适用于确定治疗的功效，或者确定治疗是否是合适的，或者癌症患者的结果的预后是不良的还是好的。例如，术语“基因组合”或“风险评分”应被理解为意指所述基因的归一化表达的线性组合或加权和。风险评分的值越大，则指示侵袭性或复发性癌症的风险就越高，并且结果越差，则5年或10年存活率就越低，治疗就不起作用等。风险评分的值越小，则指示侵袭性或复发性癌症的风险就越低，并且结果越好，则5年和/或10年存活率就越高，则治疗就起作用等。n个基因组合的风险评分计算如下：
144、风险评分＝w1 x g1+w2 x g2+…+wn x gn(等式1)
145、其中，
146、w＝可以是正数或负数的基因特异性实数常数
147、g＝基因特异性归一化表达值
148、在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定不超过200个其它基因的表达产物的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定不超过100个其它基因的表达产物的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定不超过20个其它基因的表达产物的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定不超过15个其它基因的表达产物的表达值。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测定不超过10个其它基因的表达产物的表达值。
149、在前述方面的一些实施例中，给定基因的表达值可以相对于一个或多个参考基因或参考蛋白的表达值归一化。
150、在一些实施例中，参考值可以是与待确定的ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5、foxm1中的一个或多个的表达值的样品/受试者具有类似细胞类型、样品类型、样品处理和/或从具有类似年龄、性别和其它人口统计学参数的受试者获得的样品中的表达值。在一些实施例中，测试样品和对照参考样品是相同类型的，即，从相同的生物来源获得，并且包括相同的组成，例如，相同的细胞数量和细胞类型。
151、测试样品可以通过从受试者中取出样品来获得，但也可以通过使用先前分离的样品(例如，在先前时间点分离并由同一人或另一人分离)来实现。
152、在各方面中的任何方面的一些实施例中，测试样品可以是未经处理的测试样品。如本文所使用的，短语“未经处理的测试样品”是指除了稀释和/或悬浮在溶液中之外，之前未进行任何样品预处理的测试样品。用于处理测试样品的示例性方法包含但不限于离心、过滤、超声处理、均质化、加热、冷冻和解冻以及其组合。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测试样品可以是冷冻测试样品(例如，冷冻组织)。在采用本文所描述的方法、测定和系统之前，冷冻样品可以被解冻。解冻后，冷冻样品可以在经受本文所描述的方法、测定和系统之前进行离心。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测试样品是澄清的测试样品，例如，通过离心和收集包括澄清的测试样品的上清液。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测试样品可以是预处理的测试样品，例如，由选自由离心、过滤、解冻、纯化以及其任何组合组成的组的处理产生的上清液或滤液。在各方面中的任何方面的一些实施例中，测试样品可以用化学和/或生物试剂处理。在处理期间，可以采用化学和/或生物试剂来保护和/或保持样品的稳定性，包含其中的生物分子(例如，核酸和蛋白质)。一种示例性试剂是蛋白酶抑制剂，该蛋白酶抑制剂通常用于在处理期间保护或保持蛋白质的稳定性。本领域技术人员知道适于如本文所描述的用于测定表达产物的水平所需的生物样品预处理的方法和过程。
153、在各方面中的任何方面的一些实施例中，本文所描述的方法、测定和系统可以进一步包括从受试者获得或已经获得测试样品的步骤。在各方面中的任何方面的一些实施例中，受试者可以是人类受试者。在各方面中的任何方面的一些实施例中，受试者可以是需要治疗(例如，患有或被诊断为患有前列腺癌)的受试者，或者是如本文其它地方所描述的具有患前列腺癌风险或患前列腺癌风险增加的受试者。
154、在各方面中的任何方面的一些实施例中，从受试者获得的样品可以是活检样品。在各方面中的任何方面的一些实施例中，从受试者获得的样品可以是血液或血清样品。
1.一种预测个体的侵袭性或复发性前列腺癌的风险的方法，所述方法包括测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性前列腺癌的受试者的生物样品中的所述两个基因或由所述编码的蛋白质的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体患有侵袭性或复发性前列腺癌的风险增加。
2.一种预测患有前列腺癌的个体在治疗后前列腺癌复发或进展的风险的方法，所述方法包括：测定从所述个体获得的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从治疗后没有前列腺癌复发或进展的受试者获得的生物样品的所述两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体在所述治疗后前列腺癌复发的风险或前列腺癌进展的风险增加。
3.一种确定被诊断患有前列腺癌的个体的5年存活率或10年存活率的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合是来自从前列腺癌诊断后5年或10年后从前列腺癌中幸存下来的受试者获得的生物样品的至少两个基因时，预测所述个体的5年存活率或10年存活率降低。
4.一种鉴定适合于用用于预防前列腺癌复发或进展的疗法进行治疗的前列腺癌患者的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用所述疗法治疗后相对于施用所述疗法治疗前来自相同个体的生物样品中所述两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，预测所述个体不适合于所述疗法治疗。
5.一种用于监测患有前列腺癌的个体的前列腺癌治疗的有效性的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用所述治疗后相对于施用所述治疗前来自相同个体的生物样品中所述两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，所述治疗是无效的，并且预测所述个体具有不良结果。
6.根据权利要求4或权利要求5所述的方法，其中所述治疗疗法或治疗是主动监测、新辅助疗法、辅助疗法、手术或其组合。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述新辅助疗法和所述辅助疗法是选自以下的药剂：环磷酰胺(cyclophosphamide)、甲氨蝶呤(methotrexate)、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)、吉西他滨(gemcitabine)、阿霉素(doxorubicin)(c27h29no11)、紫杉醇(paclitaxel)(c47h51no14)、卡培他滨(capecitabine)(c15h22fn3o6)、多西他赛(docetaxel)(c43h53no14)、卡巴他赛(cabazitaxel)(c45h57no14)、米托蒽醌(mitoxantrone)(c22h28n4o6)和雌莫司汀(estramustine)(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)以及促黄体激素释放(lhrh)激动剂，所述lhrh激动剂选自亮丙瑞林(leuprorelin)(c59h84n16o12)、戈舍瑞林(goserelin)(c59h84n18o14)、曲普瑞林(triptorelin)(c64h82n18o13)、甲磺酸亮丙瑞林(euprolidemesylate)(c60h88n16o15s)、地加瑞克(degarelix)(c82h103cln18o16)以及瑞卢戈利(relugolix)(c29h27f2n7o5s)。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其进一步包括测定来自所述个体的所述生物样品中至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，所述基因选自mcm3、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述至少一个基因是mcm3。
10.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其进一步包括测定来自所述个体的所述生物样品中至少两个基因的表达的步骤，所述至少两个基因选自cul4a、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1、spag5和foxm1。
11.根据权利要求10所述的方法，其中所述至少两个基因是mcm3和foxm1。
12.一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，所述方法包括测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性癌症的受试者的生物样品中的所述两个基因或由所述编码的蛋白质的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
13.一种预测患有癌症的个体在治疗后癌症复发或进展的风险的方法，所述方法包括：测定从所述个体获得的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由所述基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从治疗后没有癌症复发或进展的受试者获得的生物样品的所述两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体在所述治疗后癌症复发的风险或癌症进展的风险增加。
14.一种确定被诊断患有癌症的个体的5年存活率或10年存活率的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从癌症诊断后5年或10年后从癌症中幸存下来的受试者获得的生物样品的所述两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体的5年存活率或10年存活率降低。
15.一种鉴定适合于用用于预防癌症复发或进展的疗法进行治疗的癌症患者的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用所述疗法治疗后相对于施用所述疗法治疗前来自相同个体的生物样品中所述两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，预测所述个体不适合于所述疗法治疗。
16.一种用于监测患有癌症的个体的癌症治疗的有效性的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中两个基因ttc21b和mtus1或由这些基因编码的蛋白质的表达，其中当所述两个基因的归一化表达值的组合在施用所述治疗后相对于施用所述治疗前来自相同个体的生物样品中所述两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相同或增加时，所述治疗是无效的，并且预测所述个体具有不良结果。
17.根据权利要求15或16中任一项所述的方法，其中所述治疗疗法是主动监测、新辅助疗法、辅助疗法、手术或其组合。
18.根据权利要求17所述的方法，其中所述新辅助疗法和所述辅助疗法是选自以下的药剂：环磷酰胺、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、阿霉素(c27h29no11)、紫杉醇(c47h51no14)、卡培他滨(c15h22fn3o6)、多西他赛(c43h53no14)、卡巴他赛(c45h57no14)、米托蒽醌(c22h28n4o6)和雌莫司汀(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)以及促黄体激素释放(lhrh)激动剂，所述lhrh激动剂选自亮丙瑞林(c59h84n16o12)、戈舍瑞林(c59h84n18o14)、曲普瑞林(c64h82n18o13)、甲磺酸亮丙瑞林(c60h88n16o15s)、地加瑞克(c82h103cln18o16)以及瑞卢戈利c29h27f2n7o5s)。
19.根据权利要求12至18中任一项所述的方法，其进一步包括测定来自所述个体的所述生物样品中至少一个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，所述基因选自mcm3、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5。
20.根据权利要求19所述的方法，其中所述至少一个基因是mcm3。
21.根据权利要求16至18中任一项所述的方法，其进一步包括测定来自所述个体的所述生物样品中至少两个基因的表达的步骤，所述至少两个基因选自cul4a、mcm3、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1、spag5和foxm1。
22.根据权利要求21所述的方法，其中所述至少两个基因是mcm3和foxm1。
23.根据权利要求12至22中任一项所述的方法，其中所述癌症选自包括以下的组：多发性骨髓瘤、前列腺癌、胶质母细胞瘤、淋巴瘤、纤维肉瘤；粘液肉瘤；脂肪肉瘤；软骨肉瘤；骨原性肉瘤；脊索瘤；血管肉瘤；内皮肉瘤；淋巴管肉瘤；淋巴管内皮肉瘤(lymphangioendotheliosarcoma)、滑膜瘤；间皮瘤；尤文氏瘤(ewing's tumour)、平滑肌肉瘤；横纹肌肉瘤；结肠癌；胰腺癌；卵巢癌；鳞状细胞癌；基底细胞癌；腺癌；汗腺癌；皮脂腺癌；乳头状癌；乳头状腺癌；囊腺癌；髓样癌；支气管原癌；肾细胞癌；肝细胞瘤；胆管癌；绒毛膜癌；精原细胞瘤、胚胎性癌；维尔姆斯瘤(wilms'tumour)；宫颈癌；子宫癌；睾丸肿瘤；肺癌；小细胞肺癌；膀胱癌；上皮癌；神经胶质瘤；星形细胞瘤；成神经管细胞瘤；颅咽管瘤；室管膜瘤；松果体瘤；成血管细胞瘤；听神经瘤；少突胶质细胞瘤；脑膜瘤；黑色素瘤；视网膜母细胞瘤；头颈癌类型；膀胱癌类型；结直肠癌；以及白血病。
24.根据权利要求23所述的方法，其中所述癌症是前列腺癌。
25.根据权利要求12至22中任一项所述的方法，其中所述癌症是选自包括以下的组的前期癌：巴雷特食管(barrett's oesophagus)、鲍恩氏病(bowen's disease)、家族性腺瘤性息肉病、小叶原位癌、林奇综合征(lynch syndrome)、men2、阴道上皮内瘤形成和外阴上皮内瘤形成。
26.一种预测个体的侵袭性或复发性癌症的风险的方法，所述方法包括测定来自所述个体的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达的步骤，所述基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当所述至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自患有非侵袭性或非复发性癌症的受试者的生物样品中的所述至少两个基因或由所述编码的蛋白质的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体患有侵袭性或复发性癌症的风险增加。
27.一种预测患有癌症的个体在治疗后癌症复发或进展的风险的方法，所述方法包括：测定从所述个体获得的生物样品中至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的表达，所述基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当所述至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从治疗后没有癌症复发或进展的受试者获得的生物样品的所述至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体在所述治疗后癌症复发的风险或癌症进展的风险增加。
28.一种确定被诊断患有癌症的个体的5年存活率或10年存活率的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，所述基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当所述至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合相对于来自从癌症诊断后5年或10年后从癌症中幸存下来的受试者获得的生物样品的所述至少两个基因的归一化表达值的组合改变时，预测所述个体的5年存活率或10年存活率降低。
29.一种鉴定适合于用用于预防癌症复发或进展的疗法进行治疗的癌症患者的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，所述基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当所述至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用所述疗法治疗后相对于施用所述疗法治疗前来自相同个体的生物样品中所述至少两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，预测所述个体不适合于所述疗法治疗。
30.一种用于监测患有前列腺癌的个体的癌症治疗的有效性的方法，所述方法包括：测定来自所述个体的生物样品中至少两个基因或由这些基因编码的蛋白质的表达，所述基因选自ttc21b、mcm3、mtus1、foxm1、cul4a、gpc1、pcna、irf7、brip1、ulk1和spag5，其中当所述至少两个基因或由所述基因编码的蛋白质的归一化表达值的组合在施用所述治疗后相对于施用所述治疗前来自相同个体的生物样品中所述至少两个基因的归一化表达值的组合相同或增加时，所述治疗是无效的，并且预测所述个体具有不良结果。
31.根据权利要求29或30所述的方法，其中所述治疗疗法或治疗是主动监测、新辅助疗法、辅助疗法、手术或其组合。
32.根据权利要求31所述的方法，其中所述新辅助疗法和所述辅助疗法是选自以下的药剂：环磷酰胺、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、阿霉素(c27h29no11)、紫杉醇(c47h51no14)、卡培他滨(c15h22fn3o6)、多西他赛(c43h53no14)、卡巴他赛(c45h57no14)、米托蒽醌(c22h28n4o6)和雌莫司汀(3-(双(2-氯乙基)氨基甲酸酯)雌二醇酯；c23h31cl2no3)以及促黄体激素释放(lhrh)激动剂，所述lhrh激动剂选自亮丙瑞林(c59h84n16o12)、戈舍瑞林(c59h84n18o14)、曲普瑞林(c64h82n18o13)、甲磺酸亮丙瑞林(c60h88n16o15s)、地加瑞克(c82h103cln18o16)以及瑞卢戈利(c29h27f2n7o5s)。
33.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中所述至少两个基因中的第一基因选自ttc21b、pcna、irf7、ulk1、spag5和foxm1，并且所述至少两个基因中的第二基因选自brip1、cul4a、gpc1、mcm3和mtus1；或者其中所述至少两个基因任选地选自ttc21b、pcna、irf7、ulk1、spag5和foxm1；或者其中所述至少两个基因任选地选自brip1、cul4a、gpc1、mcm3和mtus1。
34.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中所选择的所述至少两个基因是mtus1和mcm3。
35.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中所选择的所述至少两个基因是ttc21b和mcm3。
36.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中所选择的所述至少两个基因是ttc21b和mtus1。
37.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中至少三个基因选自cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1、spag5和foxm1，并且其中这三个基因是ttc21b、mcm3和mtus1。
38.根据权利要求26至32中任一项所述的方法，其中至少四个基因选自cul4a、ttc21b、mcm3、gpc1、pcna、mtus1、irf7、brip1、ulk1、spag5和foxm1，并且其中这四个基因是ttc21b、mcm3、mtus1和foxm1。
39.根据权利要求26至38中任一项所述的方法，其中所述癌症选自包括以下的组：多发性骨髓瘤、前列腺癌、胶质母细胞瘤、淋巴瘤、纤维肉瘤；粘液肉瘤；脂肪肉瘤；软骨肉瘤；骨原性肉瘤；脊索瘤；血管肉瘤；内皮肉瘤；淋巴管肉瘤；淋巴管内皮肉瘤(lymphangioendotheliosarcoma)、滑膜瘤；间皮瘤；尤文氏瘤(ewing's tumour)、平滑肌肉瘤；横纹肌肉瘤；结肠癌；胰腺癌；卵巢癌；鳞状细胞癌；基底细胞癌；腺癌；汗腺癌；皮脂腺癌；乳头状癌；乳头状腺癌；囊腺癌；髓样癌；支气管原癌；肾细胞癌；肝细胞瘤；胆管癌；绒毛膜癌；精原细胞瘤、胚胎性癌；维尔姆斯瘤(wilms'tumour)；宫颈癌；子宫癌；睾丸肿瘤；肺癌；小细胞肺癌；膀胱癌；上皮癌；神经胶质瘤；星形细胞瘤；成神经管细胞瘤；颅咽管瘤；室管膜瘤；松果体瘤；成血管细胞瘤；听神经瘤；少突胶质细胞瘤；脑膜瘤；黑色素瘤；视网膜母细胞瘤；头颈癌类型；膀胱癌类型；结直肠癌；以及白血病。
40.根据权利要求39所述的方法，其中所述癌症是前列腺癌。
41.根据权利要求26至38中任一项所述的方法，其中所述癌症是选自包括以下的组的前期癌：巴雷特食管、鲍恩氏病、家族性腺瘤性息肉病、小叶原位癌、林奇综合征、men2、阴道上皮内瘤形成和外阴上皮内瘤形成。
