本发明属于动物分子育种,涉及与湖羊产羔数性状相关的snp标记在湖羊育种中的应用。
背景技术:
1、产羔数是家养动物繁殖能力的关键指标,直接影响养殖效益。湖羊是中国地方优良绵羊品种,其繁殖率高且适应性强。在高原环境下,低氧环境影响母羊的生理状态,尤其在妊娠期,母羊需要更高的氧气供应来维持自身及胎儿的正常发育。因此高原的低氧环境可能影响湖羊的产羔数,这对维持湖羊的高繁性能提出了新的挑战和需求。
2、epas1又名低氧诱导因子2α(hif-2α),是低氧诱导因子家族中的重要成员,可感知并响应细胞内氧气浓度的变化。在正常氧气水平下,hif-2α被泛素化降解,而在低氧条件下,hif-2α则处于稳定状态,进入细胞核与hif-1β结合,激活多个低氧应答相关基因的表达。epas1在红细胞生成、铁代谢和血管生成中发挥至关重要的作用,通过调节促红细胞生成素(epo)的表达,直接促进红细胞的生成,从而提高低氧环境下血液的氧气携带能力。epas1也可上调肠道中二价金属离子转运体(dmt1)和细胞色素b(dcytb)的表达,增强铁的吸收和利用,支持红细胞生成。epas1调控血管内皮生长因子(vegf)的表达,促进血管生成,增加胎盘血管的数量和通透性,为胎儿提供充足的氧气和营养,有利于妊娠期母羊和其胎儿的发育。因此epas1基因可能参与调控绵羊繁殖性能。本发明发现epasi基因中与湖羊产羔数相关的snp标记,说明epas1基因参与湖羊在低氧环境条件下繁殖,为湖羊产羔数的标记辅助选择提供遗传标记资源。
技术实现思路
1、本发明为解决现有选育绵羊产羔数所存在的技术问题提供一种方法。
2、根据本发明的实施例,所述snp标记位于seq id no:1所示核苷酸序列的第461位碱基处,该snp标记位点的tt基因型湖羊个体的产羔数均显著高于cc基因型个体。通过检测湖羊的上述snp标记,能够有效地预测其产羔数,从而能够根据该snp标记位点的基因型评估湖羊个体的产羔性能。因此,本发明的snp标记与湖羊的产羔数量性状有密切关联,能够有效应用于湖羊的分子标记辅助育种,进而根据实际育种需求对绵羊育种素材进行选择,从而准确、高效地筛选出多羔优良个体,提高育种选择的效率和准确性。
3、本发明提供一种用于检测权利要求1所述snp标记的引物对。根据本发明的实施例,所述引物对为具有序列表中seq id no:2和seq id no:3所示的核苷酸序列,用于检测所述snp标记。
4、根据本发明的实施例,本发明提供了一种预测绵羊高产羔数的方法,利用本发明的引物对、扩增程序和扩增体系能够有效地扩增待测湖羊的上述与产羔数性状相关的snp标记所在片段,通过测序能够有效实现对这种snp标记的检测,确定待测湖羊该snp标记位点的基因型,进而能够有效预测待测湖羊产羔数。具体地,该snp标记位点的tt基因型可以作为判断湖绵羊产羔数多少的重要标准。在湖羊选育工作中可以通过保留该snp标记位点基因型为tt基因型的绵羊用于繁育,淘汰该snp标记位点基因型为cc和tc的绵羊。由此,本发明能够有效应用于湖羊的分子标记辅助选择育种,从而以低成本和高准确性筛选出产羔数多的湖羊个体。
5、本发明具有以下有益效果:(1)本发明提供的snp标记与湖羊的产羔数显著相关,tt基因型绵羊的产羔数均显著高于cc基因型。(2)通过识别上述特定snp标记,可以帮助育种者在选择高产羔个体时提供精准依据,增强了选育的科学性和可靠性。(3)本发明提供的检测方法操作简便,利用pcr扩增和常规测序技术即可准确检测目标snp位点的基因型。此方法不仅成本低廉,而且适用于大规模筛选和应用,具有良好的推广应用前景。
1.一种根据与绵羊产羔数性状相关分子标记选择绵羊的方法,所述分子标记位于绵羊epas1基因第17外显子区域,具体的核苷酸序列为seq id no:1,其中该序列第461bp位点的tt基因型绵羊个体的产羔数显著高于cc基因型个体;其方法包括以下步骤:
2.权利要求1所述snp标记在筛选具有高产羔数湖羊中的应用,选择所述分子标记的tt基因型绵羊个体留种。
