本发明涉及计算机辅助药物设计领域,尤其是涉及一种化合物db07268在制备racgap1抑制剂中的应用。
背景技术:
1、rac-gtp酶激活蛋白1(rac gtpase-activating protein 1,racgap1)属于鸟嘌呤三磷酸酶(gtpase)激活蛋白家族成员,它调节rho gtpase从鸟嘌呤三磷酸结合到鸟嘌呤二磷酸结合形式的转化。racgap1参与了多种细胞过程,包括胞质分裂、分化和迁移,并通过形成中心纺锤体蛋白复合物和介导肌动球蛋白收缩环组装所需的rho依赖的信号通路来控制胞质分裂。
2、研究发现,racgap1在肝癌、胃癌、宫颈癌及高级别脑膜瘤等多种肿瘤中存在表达异常,通过调控细胞周期等多个信号通路的传导,参与肿瘤的发生发展。
3、以往针对racgap1的研究都是通过敲低/过表达racgap1,目前尚无直接作用于racgap1的靶向抑制剂,这大大限制了其临床转化与应用价值。
4、db07268的化学式为c17h15n5o2,db07268结构式如图1所示。2007年,mei liu等学者合成了db07268,并验证其为有效的jnk1抑制剂(liu m,et al.,discovery of a newclass of 4-anilinopyrimidines as potent c-jun n-terminal kinase inhibitors:synthesis and sar studies.bioorg med chem lett,2007.17(3):668-72.)。然而,尚无研究表明db07268与racgap1的作用关系。
技术实现思路
1、本发明的目的就是为了提供一种化合物db07268在制备racgap1抑制剂中的应用。本发明通过大规模虚拟对接、cck8实验筛选出可能与racgap1蛋白存在相互作用的候选化合物,并通过spr实验加以验证,进一步筛选出与racgap1亲和力最高的化合物db07268,最后通过细胞实验、分子实验验证其作用效果。
2、本发明的目的可以通过以下技术方案来实现:
3、一种化合物db07268在制备racgap1抑制剂中的应用,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
4、
5、进一步地,所述racgap1抑制剂中化合物db07268的浓度范围为1.563μm~50μm。
6、本发明还提供一种化合物db07268在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
7、
8、进一步地,所述药物为抑制肿瘤细胞中racgap1表达的药物。
9、上述更进一步地,所述肿瘤细胞为生长激素型垂体瘤gh3细胞。
10、本发明还提供一种化合物db07268在制备抑制肿瘤细胞生长的药物中的应用,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
11、
12、进一步地,所述肿瘤细胞为生长激素型垂体瘤gh3细胞。
13、本发明还提供一种racgap1抑制剂在制备预防和/或治疗racgap1相关疾病的药物中的应用。
14、进一步地,所述racgap1抑制剂中含有如式i所示的化合物:
15、
16、进一步地,所述racgap1相关疾病包括肿瘤、糖尿病肾病、急性肾损伤、先天性心脏病、先天性红细胞生成异常性贫血和病毒感染性疾病等。
17、此外,本发明还提供一种racgap1抑制剂的筛选方法,具体步骤如下:
18、s1、采用高通量虚拟筛选和标准精度模式进行分子对接,筛选出racgap1蛋白候选化合物a;
19、s2、采用cck8细胞增殖实验,检测步骤s1中得到的候选化合物a对gh3细胞增殖的影响,进一步地筛选出候选化合物b;
20、s3、运用表面等离子体共振技术建立racgap1蛋白-候选化合物b相互作用测定模型,筛选出与racgap1蛋白亲和力最高的化合物;
21、s4、通过western blot实验和cck8细胞增殖实验对筛选到的化合物进行评估比较。
22、与现有技术相比,本发明的有益效果如下所示:
23、1、本发明发现db07268作为racgap1抑制剂,可用于racgap1相关疾病的靶向治疗,如各类肿瘤、糖尿病肾病、急性肾损伤、先天性心脏病、先天性红细胞生成异常性贫血、病毒感染性疾病等。
24、2、现有文献报道,db07268为jnk抑制剂,而尚无研究表明db07268与racgap1的作用关系,且目前尚无针对racgap1的靶向抑制剂,本发明首次筛选并验证出racgap1抑制剂db07268。
1.一种化合物db07268在制备racgap1抑制剂中的应用,其特征在于,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
2.根据权利要求1所述的一种化合物db07268在制备racgap1抑制剂中的应用,其特征在于,所述racgap1抑制剂中化合物db07268的浓度范围为1.563μm~50μm。
3.一种化合物db07268在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用,其特征在于,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
4.根据权利要求3所述的一种化合物db07268在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用,其特征在于,所述药物为抑制肿瘤细胞中racgap1表达的药物。
5.根据权利要求4所述的一种化合物db07268在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用,其特征在于,所述肿瘤细胞为生长激素型垂体瘤gh3细胞。
6.一种化合物db07268在制备抑制肿瘤细胞生长的药物中的应用,其特征在于,所述化合物db07268为如式i所示的化合物:
7.根据权利要求6所述的一种化合物db07268在制备抑制肿瘤细胞生长的药物中的应用,其特征在于,所述肿瘤细胞为生长激素型垂体瘤gh3细胞。
8.一种racgap1抑制剂在制备预防和/或治疗racgap1相关疾病的药物中的应用。
9.根据权利要求8所述的一种racgap1抑制剂在制备预防和/或治疗racgap1相关疾病的药物中的应用,其特征在于,所述racgap1抑制剂中含有如式i所示的化合物:
10.根据权利要求8所述的一种racgap1抑制剂在制备预防和/或治疗racgap1相关疾病的药物中的应用,其特征在于,所述racgap1相关疾病包括肿瘤、糖尿病肾病、急性肾损伤、先天性心脏病、先天性红细胞生成异常性贫血和病毒感染性疾病。
