本公开涉及生物医学,尤其涉及一种血栓形成倾向患者检测生物标记物。
背景技术:
1、在分子生物学复杂的领域中,调控基因表达和细胞功能的机制错综复杂且相互关联。dna甲基化在调节基因表达模式方面起着关键作用,协调从胚胎发育到疾病发生的各种生物过程。同时,血栓形成倾向以增加血凝块形成的倾向为特征,表现出复杂的临床表型,既有遗传因素也有环境因素。尽管传统上被视为独立的研究领域,近年来的科学研究开始揭示dna甲基化动态与血栓形成倾向病因学之间的有趣交叉点。
2、了解dna甲基化的基本原理对于理解其在血栓形成倾向中的潜在影响至关重要。dna甲基化是一种可逆的表观遗传修饰,涉及在cpg二核苷酸的胞嘧啶残基上添加甲基基团,主要发生在基因启动子区域。这种修饰可以通过调节染色质结构和转录元件的可及性对基因表达产生深远的调控影响。在血栓形成倾向的背景下,异常的dna甲基化模式可能导致参与止血和血栓形成通路的基因表达失调。例如,编码凝血因子和血小板受体的基因甲基化状态的改变已被认为与血栓性疾病相关,突显了表观遗传机制在血栓形成倾向病理学中的潜在相关性。
3、在讨论dna甲基化与血栓形成倾向时,遗传易感性与环境因素之间的复杂相互作用是关键。虽然凝血相关基因的遗传突变长期以来被认为是血栓形成倾向风险的主要决定因素,表观遗传修饰的影响为这一范式增加了一层复杂性。表观遗传改变,包括dna甲基化变化,可以由饮食、生活方式因素和毒素暴露等多种环境刺激诱导。重要的是,这些表观遗传修饰可以调节与血栓形成倾向相关的遗传变异的表型表达,从而影响个体发生血栓事件的易感性。揭示遗传和表观遗传因素之间的动态相互作用有望阐明血栓形成倾向的多因素本质,并推进个性化的血栓预防和管理方法。
4、基于dna甲基化分子标志物的疾病早筛虽然逐渐获得人们的关注,但真正应用在血栓形成倾向方面的很少。因此,寻找可用于检测血栓形成倾向的标记物,对于血栓的早期筛查、临床干预、以及指导患者治疗具有重要意义。
技术实现思路
1、为克服相关技术中存在的问题,本说明书提供了一种血栓形成倾向患者检测生物标记物,对于血栓的早期筛查、临床干预、以及指导患者治疗具有重要意义。
2、根据本公开的第一方面,提供一种血栓形成倾向患者检测生物标记物,包括目标区域的cpg位点,所述目标区域包括f5基因或\和protein s基因,所述f5基因的核苷酸序列如seq id no:23所示,所述protein s基因的核苷酸序列如seq id no:17所示。
3、在本公开一些示例性实施例中,所述生物标记物为所述目标区域的cpg位点的甲基化水平。
4、在本公开一些示例性实施例中,所述生物标记物包括所述f5基因的第10个cpg位点的甲基化水平和/或所述protein s基因的第29至33个cpg位点的甲基化水平;
5、所述f5基因的第10个cpg位点对应所述f5基因核苷酸序列的碱基位置为351bp处,所述protein s基因的第29至33个cpg位点对应的所述protein s基因的核苷酸序列的碱基位置分别为299bp,306bp,308bp,311bp,314bp处。
6、根据本公开第二个方面,提供一种用于血栓形成倾向患者检测的试剂盒组,包括甲基化dna亚硝酸盐处理试剂盒和pcr扩增试剂盒,所述dna亚硝酸盐处理试剂盒用于对如第一方面所述的目标区域进行处理,使得所述目标区域中的非甲基化的胞嘧啶发生脱氨基反应从而转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不能发生脱氨基反应,仍保留为胞嘧啶;
7、所述pcr扩增试剂盒用于对如第一方面所述的目标区域进行pcr扩增。
8、在本公开一些示例性实施例中,所述pcr扩增试剂盒包括用于对所述目标区域进行pcr扩增的引物对。
9、在本公开一些示例性实施例中,所述引物对包括第一引物对和/或第二引物对;
10、所述第一引物对包括第一5'-引物和第一3'-引物,所述第一5'-引物的核苷酸序列如seq id no:1所示,所述第一3'-引物的核苷酸序列如seq id no:2所示;
11、所述第二引物对包括第二5'-引物和第二3'-引物,所述第二5'-引物的核苷酸序列如seq id no:13所示,所述第二3'-引物的的核苷酸序列如seq id no:14所示。
12、在本公开一些示例性实施例中,所述试剂盒组还包括dna提取试剂盒。
13、根据本公开的第三个方面,提供一种血栓形成倾向患者外周静脉血样的检测方法,采用如第二方面所述的试剂盒进行检测。
14、在本公开一些示例性实施例中,提取外周静脉血样白细胞中的基因组dna,检测所述f5基因或/和所述protein s基因的cpg位点的甲基化水平。
15、在本公开一些示例性实施例中,检测所述f5基因的第10个cpg位点的甲基化水平和/或所述protein s基因的第29至33个cpg位点的甲基化水平;
16、所述f5基因的第10个cpg位点对应所述f5基因核苷酸序列的碱基位置为351bp处,所述protein s基因的第29至33个cpg位点对应的所述protein s基因的核苷酸序列的碱基位置分别为299bp,306bp,308bp,311bp,314bp处。
17、本公开提供的技术方案可以包括以下有益效果:
18、本公开提供了一种血栓形成倾向患者检测生物标记物和试剂盒组,通过分析受试者外周静脉血样白细胞中特定dna甲基化位点的变化,实现了对血栓病风险的早期预测和准确诊断。具体地,通过检测f5.24.cpg.10和protein s.44.cpg.29-33位点的甲基化水平,可用于预测、诊断或辅助诊断血栓形成。接收者操作特征曲线(roc)分析显示,这些位点的预测准确性非常高,面积下曲线(auc)分别达到0.9297和0.8437,对临床医学具有重要意义。
19、应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,并不能限制本说明书。
1.一种血栓形成倾向患者检测生物标记物,其特征在于,包括目标区域的cpg位点,所述目标区域包括f5基因或\和protein s基因,所述f5基因的核苷酸序列如seq id no:23所示,所述protein s基因的核苷酸序列如seq id no:17所示。
2.根据权利要求1所述的生物标记物,其特征在于,所述生物标记物为所述目标区域的cpg位点的甲基化水平。
3.根据权利要求2所述的生物标记物,其特征在于,所述生物标记物包括所述f5基因的第10个cpg位点的甲基化水平和/或所述protein s基因的第29至33个cpg位点的甲基化水平;
4.一种用于血栓形成倾向患者检测的试剂盒组,其特征在于,包括甲基化dna亚硝酸盐处理试剂盒和pcr扩增试剂盒,所述dna亚硝酸盐处理试剂盒用于对如权利要求1至3任一项所述的目标区域进行处理,使得所述目标区域中的非甲基化的胞嘧啶发生脱氨基反应从而转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不能发生脱氨基反应,仍保留为胞嘧啶;
5.根据权利要求4所述的试剂盒组,其特征在于,所述pcr扩增试剂盒包括用于对所述目标区域进行pcr扩增的引物对。
6.根据权利要求5所述的试剂盒组,其特征在于,所述引物对包括第一引物对和/或第二引物对;
7.根据权利要求4所述的试剂盒组,其特征在于,所述试剂盒组还包括dna提取试剂盒。
8.一种血栓形成倾向患者外周静脉血样的检测方法,其特征在于,采用如权利要求4至7任一项所述的试剂盒进行检测。
9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于,提取外周静脉血样白细胞中的基因组dna,检测所述f5基因或/和所述protein s基因的cpg位点的甲基化水平。
10.如权利要求9所述的检测方法,其特征在于,检测所述f5基因的第10个cpg位点的甲基化水平和/或所述protein s基因的第29至33个cpg位点的甲基化水平;
