本发明涉及粪便检测,尤其涉及一种粪便样本保存液及其制备方法、粪便样本保存方法。
背景技术:
1、胃肠道感染传染源主要包括细菌、病毒和寄生虫,这些都会导致包括胃和小肠在内的胃肠道发炎,其症状包括腹泻和脱水,是胃肠道感染的主要危害。尽管胃肠炎对健康成年人不是很严重,仅表现为不适和不便;但对于病重、虚弱、年幼和年老患者,却可引起危及生命的脱水和电解质失衡。
2、感染性腹泻病原学检查常用诊断手法有涂片镜检、培养、免疫分析和分子生物学方法等。传统微生物诊断方法虽为临床常用的检测方法,但费时费力、灵敏度不高,还可能存在一定的漏检情况。分子生物学技术通常比培养更敏感,耗时短,而基于高通量测序技术(next-generation sequencing,ngs)不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行富集,再进行高通量测序,然后与数据库进行比对分析,根据比对到的序列息来判断样本包含的病原微生物种类,能够快速、客观的检测临床样本中的较多病原微生物(包括病毒、细菌和寄生虫等),为临床诊断提供依据。
3、但是,目前很多医院不具备ngs检测条件,需要将待测样本转移至有条件进行检测的机构,如何对粪便样本进行保存是至关重要的问题。由于粪便中含有大量酶和细菌,这些活性物质会迅速降解样本中的核酸,导致样本质量下降,影响后续检测结果的准确性,进而影响临床治疗。因此,开发一种适用于ngs的能够稳定保存粪便样本的保存液显得尤为重要。
技术实现思路
1、有鉴于此,本发明的目的在于提供一种粪便样本保存液及其制备方法、粪便样本保存方法。本发明提供的粪便样本保存液使得粪便保存效果更佳,更适用于ngs检测。
2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
3、本发明提供了一种粪便样本保存液,包括以下浓度的组分:
4、异硫氰酸胍1~4mol/l,吐温0.1~1vol%,乙二胺四乙酸二钠10~100mmol/l,双咪唑烷基脲1~5mmol/l,二硫苏糖醇1~10mmol/l,氯化钠1~20mmol/l,十二烷基硫酸钠10~50mmol/l,三羟甲基氨基甲烷缓冲液和水,所述三羟甲基氨基甲烷缓冲液的用量使粪便样本保存液的ph值为8。
5、优选地,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
6、异硫氰酸胍2.5mol/l,吐温0.5vol%,乙二胺四乙酸二钠50mmol/l,双咪唑烷基脲2~3mmol/l,二硫苏糖醇5mmol/l,氯化钠10mmol/l,十二烷基硫酸钠35mmol/l。
7、优选地,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
8、异硫氰酸胍2.5mol/l,吐温0.5vol%,乙二胺四乙酸二钠50mmol/l,双咪唑烷基脲3mmol/l,二硫苏糖醇5mmol/l,氯化钠10mmol/l,十二烷基硫酸钠35mmol/l。
9、优选地,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
10、异硫氰酸胍2.5mol/l,吐温0.5vol%,乙二胺四乙酸二钠50mmol/l,双咪唑烷基脲2mmol/l,二硫苏糖醇5mmol/l,氯化钠10mmol/l,十二烷基硫酸钠35mmol/l。
11、优选地,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
12、异硫氰酸胍4mol/l,吐温0.1vol%,乙二胺四乙酸二钠10mmol/l,双咪唑烷基脲1mmol/l,二硫苏糖醇10mmol/l,氯化钠1mmol/l,十二烷基硫酸钠10mmol/l。
13、优选地,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
14、异硫氰酸胍1mol/l,吐温1vol%,乙二胺四乙酸二钠100mmol/l,双咪唑烷基脲5mmol/l,二硫苏糖醇1mmol/l,氯化钠20mmol/l,十二烷基硫酸钠50mmol/l。
15、优选地,所述吐温包括吐温-20。
16、本发明还提供了上述技术方案所述的粪便样本保存液的制备方法,包括以下步骤:
17、将异硫氰酸胍、吐温、乙二胺四乙酸二钠、双咪唑烷基脲、二硫苏糖醇、氯化钠、十二烷基硫酸钠、三羟甲基氨基甲烷缓冲液和水混合后过滤,得到所述粪便样本保存液。
18、本发明还提供了一种粪便样本保存方法,在粪便样本中添加上述技术方案所述的粪便样本保存液。
19、优选地,在每克粪便样本中添加5~15ml所述粪便样本保存液。
20、本发明提供了一种粪便样本保存液,包括以下浓度的组分:异硫氰酸胍1~4mol/l,吐温0.1~1vol%,乙二胺四乙酸二钠10~100mmol/l,双咪唑烷基脲1~5mmol/l,二硫苏糖醇1~10mmol/l,氯化钠1~20mmol/l,十二烷基硫酸钠10~50mmol/l,三羟甲基氨基甲烷缓冲液和水,所述三羟甲基氨基甲烷缓冲液的用量使粪便样本保存液的ph值为8。
21、与现有技术相比,本发明的有益效果如下:
22、本发明以异硫氰酸胍(gitc)作为蛋白变性剂,吐温(tween)作为辅助剂,二者搭配能迅速溶解蛋白质,抑制核酸酶对核酸的降解;乙二胺四乙酸二钠(edta-2na)作为螯合剂,螯合样本中金属离子,抑制核酸酶的反应;使用双咪唑烷基脲作为抑菌剂,主要是利用其广谱微生物抑制效果,有效抑制粪便中细菌和真菌的增殖;二硫苏糖醇(dtt)不仅能还原rnase(核糖核酸酶)蛋白质中的二硫键,使rnase酶变性,同时抑制酚类氧化引起的磷酸二酯键的断裂及导致rna和dna的交联;氯化钠(nacl)能够稳定溶液的离子浓度;十二烷基硫酸钠(sds)改变蛋白质构象,还能起到破坏细胞膜和解离核酸的作用;三羟甲基氨基甲烷缓冲液(tris-hcl)能够维持ph值稳定,为核酸提供一个合适的缓冲体系;本发明通过创造性使用吐温、双咪唑烷基脲和二硫苏糖醇,结合异硫氰酸胍、乙二胺四乙酸二钠等成分的合理配比,使得粪便保存效果更佳,更适用于ngs检测,能够在室温条件下有效保护粪便样本中的核酸至少5天,防止其在运输、保存过程中降解,确保样本的稳定性,为样本的运输、保存提供了更多的灵活性和便利。
23、且本发明中异硫氰酸胍还能灭活病毒、释放核酸,降低生物外泄传播的风险。
1.一种粪便样本保存液,其特征在于,包括以下浓度的组分:
2.根据权利要求1所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
3.根据权利要求2所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
4.根据权利要求2所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
5.根据权利要求1所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
6.根据权利要求1所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述粪便样本保存液包括以下浓度的组分:
7.根据权利要求1~6任一项所述的粪便样本保存液,其特征在于,所述吐温包括吐温-20。
8.权利要求1~7任一项所述的粪便样本保存液的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
9.一种粪便样本保存方法,其特征在于,在粪便样本中添加权利要求1~7任一项所述的粪便样本保存液。
10.根据权利要求9所述的粪便样本保存方法,其特征在于,在每克粪便样本中添加5~15ml所述粪便样本保存液。
