基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法与流程

专利2026-09-19  2


本申请涉及机器学习领域,尤其涉及一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法。


背景技术:

1、目前,评估跨品种油茶嫁接适应性的方法主要依赖于传统的统计学分析和经验判断。该领域的现有技术存在诸多不足之处,亟需改进和创新。具体而言,研究人员通常会收集嫁接后植株的各项生理指标,如存活率、生长速度、叶片特征等,然后使用简单的统计模型(如线性回归或方差分析)来分析这些数据。这种方法虽然简单直观,但难以捕捉到复杂的非线性关系和潜在的交互作用。传统方法的局限性主要体现在以下几个方面:首先,线性模型假设因变量与自变量之间存在线性关系,这在生物系统中往往不成立;其次,这些方法难以处理高维数据和多因素交互作用;再者,它们对异常值和噪声数据较为敏感,可能导致结果偏差。此外,传统方法通常忽略了时间序列特征,无法有效捕捉植物生长过程中的动态变化。

2、另一种常见的方法是利用机器学习算法,如支持向量机(svm)或随机森林(randomforest),来建立预测模型。这些模型通过学习已知的嫁接结果数据,试图预测新的嫁接组合的适应性。然而,这些方法往往需要大量的训练数据,而在实际应用中,不同品种间的嫁接实验数据可能相对有限。机器学习方法虽然在某些方面优于传统统计方法,但仍存在一些问题:首先,模型的可解释性较差,难以为研究人员提供直观的生物学解释;其次,这些模型容易过拟合,特别是在训练数据有限的情况下;再者,它们对特征选择和超参数调整较为敏感,需要大量的人工干预。

3、因此,亟需一种技术方案,从而能够增强模型的特征表示能力,提高模型在新品种上的泛化水平。


技术实现思路

1、为了解决现有技术的不足,本申请实施例提供了一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法。本申请解决了现有技术在新品种上的泛化水平较低等技术问题。

2、本申请实施例提供了一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法,包括:采集目标油茶的宏观特征和微观特征,所述宏观特征包括株高、冠幅和/或主干直径的植株形态学指标,所述微观特征包括基因表达数据;对采集的宏观特征和微观特征进行数据预处理,并构建双流神经网络;通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接;将拼接后的特征输入全连接层,并利用激活函数获取目标油茶的适应性评分。

3、一种可以的实现方式中,其中,采集目标油茶的宏观特征和微观特征,所述宏观特征包括株高、冠幅和/或主干直径的植株形态学指标,所述微观特征包括基因表达数据,包括:选取待测目标油茶的植株,采用光学测距装置测量株高,并利用长度测量工具测定冠幅,取其平均值;在植株特定高度处测量主干直径,记录叶片数量并随机抽取部分叶片;应用叶面积测定仪和叶绿素含量测定仪分别测定所述叶片的面积和叶绿素含量;在植株嫁接后的预设时间点,采集嫁接部位周围特定范围内的组织样品,并进行低温快速冷冻处理;利用核酸提取试剂提取所述组织样品的总rna,并采用分光光度计和生物分析仪检测rna的浓度、纯度和完整性;进行反转录获得cdna,采用实时定量pcr检测预选基因的表达水平。

4、一种可以的实现方式中,其中,对采集的宏观特征和微观特征进行数据预处理,包括:对所述宏观特征数据执行标准化处理,其中包括获取原始数据、计算均值和标准差,并利用z-score方法将原始数据转换为标准化数据;对所述微观特征数据进行相对表达量的定量计算,其中包括:

5、,其中,表示目标基因的ct值,表示内参基因的ct值,表示处理组的值,表示对照组的值,表示标准差,表示相对表达量。

6、一种可以的实现方式中,其中所述双流神经网络包括:宏观特征处理流和微观特征处理流;其中,在构建双流神经网络中:所述宏观特征处理流包括依次连接的输入层、多个全连接层和激活层;所述微观特征处理流包括依次连接的输入层、多个一维卷积层、池化层、全连接层和激活层,其中一维卷积层的输出经过激活后进行池化操作。

7、一种可以的实现方式中,其中,通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接,包括:将宏观和微观的特征流输出向量进行拼接,得到拼接特征向量;利用可训练参数对所述拼接特征向量进行非线性变换,并通过softmax函数计算注意力权重;根据所述注意力权重对宏观特征流输出向量和微观特征流输出向量进行加权融合,得到融合特征向量。

8、一种可以的实现方式中,其中,在通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接之前,包括:将现有的油茶品种数据划分为源域数据集和目标域数据集,其中源域数据集包含数据充足的常见品种,目标域数据集包含数据稀疏的新品种;计算源域数据集和目标域数据集之间的最大平均差异,采用高斯核函数作为特征映射函数,并通过交叉验证确定核宽度参数的取值范围;构建损失函数,包括源域数据集和目标域数据集的损失项,以及源域数据集和目标域数据集之间的最大平均差异加权项,并设置平衡参数的初始值和变化范围;采用自适应矩估计优化算法对模型进行训练,设置初始学习率、学习率衰减策略、批大小和训练迭代次数;在训练过程中,定期计算验证集上的性能指标,并保存性能最佳的模型。

9、一种可以的实现方式中,其中,构建损失函数,包括:,其中,表示总损失函数,表示源域损失,表示平衡参数,初始值为0.1,表示源域和目标域之间的最大平均差异,表示目标域损失。

10、一种可以的实现方式中,其中,最大平均差异,包括:,其中,表示源域样本数,表示源域中第i个样本,表示目标域样本数,表示目标域中第j个样本,表示高斯核函数,表示希尔伯特平方范数。

11、在如上所提供的一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法中,本申请实施例通过多尺度迁移学习框架,能够同时利用宏观和微观层面的信息,提高了模型的特征表示能力。进一步地,在一些实施例中,通过动态权重自适应算法调整源域和目标域的权重,能够提高模型在新品种上的泛化能力。



技术特征:

1.一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,采集目标油茶的宏观特征和微观特征,所述宏观特征包括株高、冠幅和/或主干直径的植株形态学指标,所述微观特征包括基因表达数据,包括:

3.根据权利要求1所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,对采集的宏观特征和微观特征进行数据预处理,包括:

4.根据权利要求1所述的适应性评估方法,其特征在于,其中所述双流神经网络包括:宏观特征处理流和微观特征处理流;

5.根据权利要求1所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接,包括:

6.根据权利要求1所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,在通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接之前,包括:

7.根据权利要求6所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,构建损失函数,包括:

8.根据权利要求7所述的适应性评估方法,其特征在于,其中,最大平均差异,包括:


技术总结
本申请公开了一种基于迁移学习的跨品种油茶嫁接的适应性评估方法,所述方法包括:采集目标油茶的宏观特征和微观特征,所述宏观特征包括株高、冠幅和/或主干直径的植株形态学指标,所述微观特征包括基因表达数据;对采集的宏观特征和微观特征进行数据预处理,并构建双流神经网络;通过注意力机制将宏观和微观的特征流输出进行拼接;将拼接后的特征输入全连接层,并利用激活函数获取目标油茶的适应性评分。通过本申请的方案,能够增强模型的特征表示能力,提高模型在新品种上的泛化水平。

技术研发人员:霍达,李芳,徐嘉娟,朱亚艳,曾钦朦,魏莹莹
受保护的技术使用者:贵州省林业科学研究院
技术研发日:
技术公布日:2024/12/17
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